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长链非编码RNA-Hexokinase 2的生物信息学分析
文献摘要：
目的 运用生物信息学分析方法,分析长链非编码RNA-Hexokinase 2(HK2)在细胞内的调控靶基因及信号通路,并对其进行生物学功能注释,阐述lncRNA-HK2在细胞内的功能作用.方法 在miRDB数据库和Starbase3.0数据库中预测与lncRNA-HK2有miRNA-lncRNA互作关系的miRNA,将结果取交集.在Starbase3.0数据库中预测miRNAs靶基因,并进行GO功能注释和Pathway通路富集分析.结果 在miRDB数据库预测到50个miRNAs与lncRNA-HK2相作用,Starbase3.0数据库预测到14个miRNAs与之相作用,取2个数据库的交集得到hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-374b-5p 2个miRNAs;GO功能注释显示hsa-miR-374a-5p的靶基因主要调控蛋白磷酸化、肿瘤发生通路、转录调控、DNA损伤反应、脂肪细胞分化及胚胎发育等基因及信号通路;hsa-miR-374b-5p作用的靶基因主要调控基因表达,调控序列特异性DNA结合转录因子的活性、翻译调控、细胞对于胰岛素的反应、细胞粘附及细胞周期等生物学过程,信号通路富集结果主要分布在TNF信号通路、RAS信号通路、人乳头状瘤病毒感染、转录错误调控及多种肿瘤信号通路等方面.结论 长链非编码RNA HK2在细胞内的重要的调控作用,具体与蛋白磷酸化、肿瘤发生通路、转录调控、DNA损伤反应、翻译以及细胞周期等多条信号通路密切相关,其主要通过上述作用通路调控生理和病理进程.
文献关键词：
长链非编码RNA-Hexokinase 2;信号通路;蛋白磷酸化
中图分类号：
作者姓名：
魏晨;蒋振
作者机构：
川北医学院基础医学与法医学院生物化学与分子生物学教研室,四川 南充 637000
文献出处：
引用格式：
[1]魏晨;蒋振-.长链非编码RNA-Hexokinase 2的生物信息学分析)[J].医学信息,2022(19):1-5,10
A类：
Starbase3
B类：
长链非编码,Hexokinase,生物信息学分析,HK2,调控靶基因,生物学功能,功能注释,lncRNA,功能作用,miRDB,互作关系,交集,miRNAs,Pathway,通路富集分析,hsa,374a,5p,374b,调控蛋白,蛋白磷酸化,肿瘤发生,转录调控,脂肪细胞分化,胚胎发育,调控基因,调控序列,列特,翻译调控,细胞粘附,细胞周期,生物学过程,信号通路富集,集结,RAS,人乳头状瘤病毒感染,多条,述作,作用通路,病理进程
AB值：
0.261307
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