典型文献
长链非编码RNA-MAL2的靶基因预测及信号通路富集分析
文献摘要：
目的 运用生物信息学分析方法,分析长链非编码RNA-MAL2(lncRNA-MAL2)在细胞内的调控靶基因及信号通路,并对其进行生物学功能注释,阐述lncRNA-MAL2在细胞内的功能作用.方法 在miRDB数据库和Starbase3.0数据库中预测与lncRNA-MAL2有miRNA-lncRNA互作关系的miRNA,将结果取交集;在Starbase3.0数据库中预测miRNAs靶基因,并进行GO功能注释和Pathway通路富集.结果 在miRDB数据库预测到95个miRNAs与lncRNA-MAL2相作用,Starbase3.0数据库预测到167个miRNAs与之相作用,取2个数据库的交集共获得5个miRNAs;GO功能注释显示其靶基因主要分布在镁离子结合、酶结合、蛋白激酶、蛋白泛素化等方面;生物学过程主要分布在细胞迁移、抑制细胞增殖、凋亡、蛋白转运和细胞周期等功能方面;信号通路富集主要分布在ErbB信号通路、生长激素合成、TNF信号通路、TGF-beta信号通路及雌激素信号通路等方面.结论 lncRNA-MAL2在细胞内的重要调控作用具体与酶结合、蛋白激酶、蛋白泛素化、细胞迁移、抑制细胞增殖、凋亡、蛋白转运和细胞周期等多条信号通路密切相关.
文献关键词：
lncRNA-MAL2;调控靶基因;细胞迁移;蛋白泛素化
中图分类号：
作者姓名：
罗瑶敏;蒋振
作者机构：
川北医学院基础医学与法医学院生物化学与分子生物学教研室,四川 南充 637000
文献出处：
引用格式：
[1]罗瑶敏;蒋振-.长链非编码RNA-MAL2的靶基因预测及信号通路富集分析)[J].医学信息,2022(19):11-14
A类：
Starbase3
B类：
长链非编码,MAL2,靶基因预测,信号通路富集,通路富集分析,生物信息学分析,lncRNA,调控靶基因,生物学功能,功能注释,功能作用,miRDB,互作关系,交集,miRNAs,Pathway,共获,镁离子,离子结合,蛋白激酶,蛋白泛素化,生物学过程,细胞迁移,抑制细胞增殖,细胞周期,ErbB,生长激素,TGF,beta,雌激素信号通路,多条
AB值：
0.233707
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