典型文献
hsa-miR-20a-3p靶基因预测及生物信息学分析
文献摘要：
目的:为深入研究hsa-miR-20a-3p的生物学功能及相关疾病的致病机制提供一定的理论基础.方法:利用miRbase等数据库分析hsa-miR-20a-3p的物种保守性,应用Targetscan、TarBase、miRDB和miRTarBase靶基因数据库预测hsa-miR-20a-3p的靶基因,并通过DAVID数据库对靶基因进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析.结果:hsa-miR-20a-3p的成熟碱基序列在各物种间高度保守;预测得到156个靶基因集合;GO功能注释分析结果显示,hsa-miR-20a-3p靶基因主要富集在核浆、细胞质、细胞核等9个细胞组分,富集在蛋白质结合、染色质结合、DNA结合等11个分子功能,富集在前脑形态发生、学习或记忆、器官诱导、基因表达调控等15个生物学过程(P<0.05);KEGG信号通路显著富集在病毒致癌、乙型肝炎以及HTLV-Ⅰ感染3个信号通路(P<0.05).结论:hsa-miR-20a-3p通过调控靶基因广泛参与多个重要的生物学过程和信号通路,尤其是病毒致癌过程是值得进一步研究的方向.
文献关键词：
hsa-miR-20a-3p;靶基因预测;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
张蕊
作者机构：
兰州大学公共卫生学院,甘肃省兰州市 730000
文献出处：
引用格式：
[1]张蕊-.hsa-miR-20a-3p靶基因预测及生物信息学分析)[J].医学理论与实践,2022(15):2521-2523,2528
A类：
B类：
hsa,20a,3p,靶基因预测,生物信息学分析,生物学功能,相关疾病,致病机制,miRbase,数据库分析,保守性,Targetscan,miRDB,miRTarBase,基因数据库,DAVID,对靶,功能注释,信号通路富集,通路富集分析,碱基序列,种间,细胞质,细胞核,蛋白质结合,染色质,前脑,形态发生,基因表达调控,生物学过程,致癌,乙型肝炎,HTLV,调控靶基因
AB值：
0.314262
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