典型文献
rno-miR-133a-3p靶基因预测及生物信息学分析
文献摘要：
目的:对rno-miR-133a-3p进行系统的生物信息学分析,预测rno-miR-133a-3p的靶基因、基因功能及信号通路.方法:利用UCSC和miRBase在线数据库对rno-miR-133a-3p进行基因定位、分析其序列保守性,然后利用miGator v3.0数据库分析rno-miR-133a-3p在人类不同疾病和组织器官中的表达情况,利用Target Scan、miRTarBase和miRDB数据库交叉预测rno-miR-133a-3p的靶基因,将上述3个数据集绘制维恩图推导得到交集靶基因,再将预测的靶基因利用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号转导通路富集分析.结果:rno-miR-133a-3p基因成熟序列高度保守,在脊髓组织中富集表达;rno-miR-133a-3p的34种关键靶基因存在细胞多个组分中,执行多种分子功能,参与多种生物过程;这些靶基因富集于细胞增殖和FoxO蛋白信号通路,编码的蛋白间形成了复杂的网络图.结论:rno-miR-133a-3p在多种组织和细胞中异常表达,通过靶基因对多种炎症发挥作用,以促进炎症作用为主,其可作为炎症及疼痛潜在的研究标记物和治疗靶标.
文献关键词：
rno-miR-133a-3p;靶基因;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
徐芒;郭继平;雷路嘉;李云庆
作者机构：
大理大学基础医学院 云南 大理白族自治州 671000
文献出处：
引用格式：
[1]徐芒;郭继平;雷路嘉;李云庆-.rno-miR-133a-3p靶基因预测及生物信息学分析)[J].健康忠告,2022(16):25-27
A类：
miGator
B类：
rno,133a,3p,靶基因预测,生物信息学分析,基因功能,UCSC,miRBase,基因定位,保守性,v3,数据库分析,组织器官,Target,Scan,miRTarBase,miRDB,维恩图,交集,DAVID,基因本体,功能分析,京都基因与基因组百科全书,信号转导通路,通路富集分析,脊髓,中富,关键靶基因,生物过程,基因富集,FoxO,网络图,异常表达,炎症作用,标记物,靶标
AB值：
0.297391
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