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小麦淀粉合酶基因家族成员的表达差异分析
文献摘要：
籽粒淀粉的含量和结构影响小麦的产量和品质,而淀粉合酶在淀粉合成中起着关键作用.植物淀粉合酶基因经多次复制和功能分化,形成了具有不同功能特性的多成员大家族.为揭示淀粉合酶基因家族成员间的序列特性和表达差异,本研究参考已知的水稻淀粉合酶蛋白序列,对小麦全基因组中的淀粉合酶基因进行鉴定,并对其进行差异表达分析.结果共鉴定到27个小麦淀粉合酶基因,这些基因分布在1A/1B/1D、2A/2B/2D、6A/6B/6D、7A/7B/7D 染色体上,可分为 Group A 和 Group B 两大类,Group A 包含 TaGB-SS、TaSSⅠ、TaSSⅡ三个亚家族,所编码的蛋白均具有motif1～motif10,且motif排列顺序一致;Group B包含TaSSⅢ、TaSSⅣ两个亚家族,所编码的蛋白都缺少motif9和motif 10,另外TaSSⅢ亚家族还缺少motif8.与玉米、水稻、高粱、拟南芥不同,小麦淀粉合酶基因没有TaSSV亚家族.同一亚家族内不同基因具有明显的表达差异,其中,TaGBSSⅠ、TaSSⅡ a和TaSSⅢa在胚乳中特异表达;小麦相同部分同源群内的淀粉合酶基因间在不同组织和不同发育时期也存在表达差异,TaSSⅡa-B和TaSSⅡa-D在授粉后20 d和30 d的胚乳中表达量比TaSSⅡa-A高.差异表达的淀粉合酶基因启动子中的胚乳特异表达元件(RY-element、AACA-motif和ACG-TOSGLUB1)存在类型和数量差异.
文献关键词：
小麦;淀粉合酶;基因家族;表达差异;顺势作用元件
中图分类号：
作者姓名：
王谢琴;李瑞雪;张红;陈娇;于小蓉;刘汉梅
作者机构：
四川农业大学生命科学学院,四川雅安625000
文献出处：
引用格式：
[1]王谢琴;李瑞雪;张红;陈娇;于小蓉;刘汉梅-.小麦淀粉合酶基因家族成员的表达差异分析)[J].麦类作物学报,2022(08):938-947
A类：
TaGB,TaSS,motif10,motif9,TaSSV,TaGBSS,AACA,TOSGLUB1
B类：
小麦淀粉,淀粉合酶,酶基因,基因家族,表达差异,籽粒淀粉,结构影响,产量和品质,淀粉合成,功能特性,大家族,序列特性,水稻,全基因组,差异表达分析,基因分布,1A,1B,1D,2A,2B,2D,6A,6B,6D,7A,7B,7D,Group,两大类,亚家族,排列顺序,motif8,高粱,拟南芥,胚乳,特异表达,不同组织,不同发育时期,授粉,基因启动子,RY,element,ACG,存在类型,顺势作用元件
AB值：
0.28962
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