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典型文献
本氏烟半胱氨酸蛋白酶基因家族特征及其在TMV侵染中的功能
文献摘要:
[目的]明确抗病毒化合物氯吲哚酰肼(chloroinconazide,CHI)诱导的本氏烟(Nicotiana benthamiana)半胱氨酸蛋白酶(cysteine proteinase,CP)在烟草花叶病毒(tobacco mosaic virus,TMV)侵染过程中的作用及其基因家族特征,为理解茄科作物抗病毒分子机制及化学调控提供理论依据.[方法]利用全基因组策略,从茄科作物基因组数据库Sol Genomics Network中检索获得本氏烟NbCP的全家族基因序列,利用生物信息学分析NbCP基因家族的进化关系、Motif基序及启动子顺式作用元件.根据生物信息分析结果,利用实时荧光定量PCR技术分析TMV侵染后NbCP基因的表达,以此筛选出潜在抗病蛋白.使用烟草脆裂病毒(tobacco rattle virus,TRV)介导的基因沉默技术和马铃薯X病毒(potato virus X,PVX)介导的基因过表达技术验证该关键蛋白对TMV-GFP侵染的影响,结合实时荧光定量PCR手段探索该关键蛋白的抗病毒机制.[结果]NbCP家族共有24个成员,根据其染色体定位命名为NbCP1—NbCP24.进化关系分析表明NbCP分成5个亚家族,其中Group V含有7个NbCP,而Group I仅含2个NbCP;Motif分析表明不同分支NbCP具有相似的motif分布;启动子顺式作用元件分析表明NbCP家族基因受光调控,并且多个NbCP家族基因启动子含有茉莉酸甲酯、水杨酸甲酯、脱落酸、赤霉素和生长素等激素响应元件.结合生物信息学分析,从上述各个亚家族中分别筛选1个关键潜在抗病相关NbCP基因(NbCP8、NbCP12、NbCP13、NbCP18、NbCP22),并利用实时荧光定量PCR技术分析上述基因在TMV侵染第5天的表达,发现NbCP8表达差异性最大,上升了2.6倍,NbCP8在叶中的表达量最高,其次是茎和根,在花中的表达量最低.TRV介导的NbCP8沉默能显著增加TMV-GFP的侵染,而PVX介导的NbCP8过表达能显著抑制TMV-GFP侵染,表明NbCP8作为植物正调控因子抑制病毒侵染.沉默NbCP8显著抑制了水杨酸信号途径相关基因PR1以及茉莉酸信号途径相关基因MYC2的表达,但对NPR1、COI1以及脱落酸信号途径相关基因ABA1和NCED1的表达无显著影响;而过表达NbCP8则显著提高了PR1以及ABA1的表达,但对NPR1、MYC2、COI1和NCED1的表达无显著影响.[结论]本氏烟NbCP参与了植物胁迫防御,其中NbCP8在抗TMV防御中起显著作用,其分子机制是通过诱导水杨酸信号途径参与抗病防御,研究结果可为茄科作物抗病毒的分子机制提供证据.
文献关键词:
本氏烟;全基因组;半胱氨酸蛋白酶;NbCP8;烟草花叶病毒
作者姓名:
裴悦宏;李凤巍;刘维娜;温玉霞;朱鑫;田绍锐;樊光进;马小舟;孙现超
作者机构:
西南大学植物保护学院植物病害生物学重庆市重点实验室,重庆 400715
文献出处:
引用格式:
[1]裴悦宏;李凤巍;刘维娜;温玉霞;朱鑫;田绍锐;樊光进;马小舟;孙现超-.本氏烟半胱氨酸蛋白酶基因家族特征及其在TMV侵染中的功能)[J].中国农业科学,2022(21):4196-4210
A类:
chloroinconazide,NbCP,rattle,NbCP1,NbCP24,NbCP8,NbCP12,NbCP13,NbCP18,NbCP22,ABA1
B类:
本氏烟,半胱氨酸蛋白酶,酶基因,基因家族,TMV,毒化,吲哚,酰肼,CHI,Nicotiana,benthamiana,cysteine,proteinase,烟草花叶病毒,tobacco,mosaic,virus,侵染过程,茄科作物,化学调控,全基因组,组策略,基因组数据,Sol,Genomics,Network,全家,家族基因,基因序列,利用生物,生物信息学分析,进化关系,Motif,基序,顺式作用元件,生物信息分析,抗病蛋白,烟草脆裂病毒,TRV,基因沉默,马铃薯,potato,PVX,基因过表达,技术验证,关键蛋白,GFP,抗病毒机制,染色体定位,关系分析,亚家族,Group,motif,光调控,基因启动子,茉莉酸甲酯,水杨酸甲酯,脱落酸,赤霉素,生长素,激素响应,响应元,表达差异,正调控,调控因子,病毒侵染,信号途径,茉莉酸信号,MYC2,NPR1,COI1,NCED1,而过,植物胁迫,胁迫防御,提供证据
AB值:
0.269782
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