典型文献
粳稻糖基转移酶Ⅰ基因家族全基因组鉴定及功能分析
文献摘要:
糖基转移酶Ⅰ(GT Ⅰ)家族是糖基转移酶中的一类,其主要功能涉及黄酮类化合物糖基的转移、淀粉和蔗糖的合成等.为揭示GTⅠ基因家族在粳稻生长发育以及抗逆中的作用,为粳稻GTⅠ基因家族成员的功能研究提供基础,为水稻的品种改良和提高水稻耐高温提供思路,采用生物信息学方法鉴定出30 个GTⅠ基因家族成员,并分析了粳稻GTⅠ基因家族成员的基因结构、蛋白质理化性质、染色体定位及基因进化、系统发育关系、保守结构域和蛋白质三维结构建模等.结果显示,粳稻的30 个GT Ⅰ基因家族成员在水稻12 条染色体上均有分布,其基因结构、保守基序和遗传进化相对保守,家族成员启动子均预测到脱落酸响应元件,家族蛋白质的三维结构保守含有 6 个β-折叠和7 个α-螺旋.通过转录组数据与实时荧光定量分析,GTⅠ基因家族大部分成员对高温胁迫的响应出现在高温处理后第6 小时,其中OS-GT29 表达量呈持续高表达.GTⅠ基因家族在拟南芥和粳稻功能存在相似.
文献关键词:
粳稻;糖基转移酶Ⅰ;基因家族;生物信息学;高温胁迫响应
中图分类号:
作者姓名:
周镇中;罗彪;骆鹰;夏敏;汪启明;饶力群
作者机构:
湖南农业大学 生物科学技术学院,道地药用植物规范化栽培与综合利用湖南省工程实验室,湖南 长沙 410128
文献出处:
引用格式:
[1]周镇中;罗彪;骆鹰;夏敏;汪启明;饶力群-.粳稻糖基转移酶Ⅰ基因家族全基因组鉴定及功能分析)[J].华北农学报,2022(06):50-62
A类:
GT29
B类:
粳稻,糖基转移酶,基因家族,全基因组鉴定,功能分析,主要功能,黄酮类化合物,蔗糖,抗逆,功能研究,水稻,品种改良,耐高温,生物信息学方法,基因结构,染色体定位,基因进化,系统发育关系,保守结构域,蛋白质三维结构,结构建模,保守基序,遗传进化,启动子,脱落酸,响应元,折叠,转录组数据,高温处理,OS,拟南芥,高温胁迫响应
AB值:
0.262916
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