典型文献
基于转录组分析ABA促进葡萄花青苷积累相关基因
文献摘要：
[目的]分析参与调控ABA促进葡萄着色的相关基因,探讨ABA促进葡萄果实花青苷积累的分子机制.[方法]以'红巴拉多'葡萄为试材,在转色前期(约花后6周)使用300 mg·L-1 ABA对果穗进行浸果处理,以清水处理为对照.观察表型,并利用超高液相色谱质谱联用仪(UPLC-MS)测定花青苷组分及含量,再利用转录组测序技术从分子水平对ABA促进花青苷积累的机制进行生物信息学分析.[结果]外源ABA处理3 d后,葡萄果实着色明显加深,花青苷种类和含量增多,其中芍药素3-O-葡萄糖苷、锦葵色素3-O-葡萄糖苷两种单体花青苷含量增加最为显著.分析ABA处理18 h和3 d后葡萄果实转录水平的差异,并通过KEGG富集分析发现了11个ABA信号通路基因以及52个与花青苷生物合成和转运相关的基因差异表达,它们均在外源ABA处理后表达上调.通过将差异基因与葡萄转录因子库进行比对,共发现297个转录因子差异表达.进一步分析差异转录因子表达模式,筛选与VvMYBA1表达模式相近的转录因子,发现15个MYB、bHLH、bZIP、NAC、Dof、HD-ZIP等家族的转录因子,其可能参与调控花青苷生物合成.启动子顺式作用元件分析表明,大部分筛选到的差异基因启动子中含有ABRE元件,说明这些差异表达基因的启动子可能为ABA诱导型启动子.对部分候选基因的表达模式进行实时荧光定量(qRT-PCR)分析,证实了RNA-seq的准确性.[结论]ABA促进葡萄花青苷积累涉及11个ABA信号转导、52个花青苷合成和转运相关基因,15个转录因子可能参与调控了这一生物过程.研究结果为揭示ABA促进葡萄花青苷积累的分子机制提供了一定基础.
文献关键词：
葡萄;花青苷;ABA;转录组;启动子
中图分类号：
作者姓名：
徐献斌;耿晓月;李慧;孙丽娟;郑焕;陶建敏
作者机构：
南京农业大学园艺学院,南京 210095
文献出处：
引用格式：
[1]徐献斌;耿晓月;李慧;孙丽娟;郑焕;陶建敏-.基于转录组分析ABA促进葡萄花青苷积累相关基因)[J].中国农业科学,2022(01):134-151
A类：
VvMYBA1
B类：
转录组分析,ABA,葡萄花,花青苷,葡萄着色,葡萄果实,巴拉,拉多,转色,果穗,超高液相,液相色谱质谱联用仪,UPLC,转录组测序技术,分子水平,生物信息学分析,果实着色,芍药,糖苷,锦葵色素,转录水平,富集分析,路基,生物合成,基因差异表达,差异基因,表达模式,bHLH,bZIP,NAC,Dof,HD,控花,顺式作用元件,分筛,基因启动子,ABRE,差异表达基因,诱导型启动子,候选基因,qRT,seq,信号转导,生物过程
AB值：
0.284889
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