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典型文献
白桦Trihelix家族全基因组鉴定及抗病表达模式分析
文献摘要:
Trihelix家族是植物中特有的一类转录因子家族,在植物生长发育、抗逆反应中具有重要的调控作用.该研究基于白桦基因组数据库,对白桦Trihelix家族基因的表达特性以及抗病功能等进行分析,为Trihelix家族成员在白桦抗病过程中的功能研究奠定基础.结果显示:(1)共筛选到白桦8个Trihelix家族成员(BpTrihelix1~BpTrihelix8),分布在6条染色体上;氨基酸分子量在35 633.96~81 871.27 Da之间,等电点在5.32~8.67之间,均为疏水性氨基酸.(2)组织特异性表达分析表明,8个家族成员在白桦根、茎、叶中均有不同程度的表达,且BpTrihelix3在根、茎、叶中的表达量均最高.(3)病原菌侵染试验结果发现,链格孢霉菌(Alternaria alternata)感染白桦植株叶片48 h和立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)感染白桦幼苗根部24 h时,BpTrihelix3、BpTrihelix4和BpTrihelix7均显著上调,其余家族基因表达量无明显变化,说明该家族基因成员中的BpTrihelix3、BpTrihelix4和BpTrihelix7响应了病原菌的感染,推测三者在白桦抗病过程中可能发挥重要作用.
文献关键词:
白桦;Trihelix家族;生物信息学;抗病;表达分析
作者姓名:
宁小萌;孙晶晶;冯思雨;李天骄;任占辰;李然红
作者机构:
牡丹江师范学院生命科学与技术学院,黑龙江牡丹江157012
文献出处:
引用格式:
[1]宁小萌;孙晶晶;冯思雨;李天骄;任占辰;李然红-.白桦Trihelix家族全基因组鉴定及抗病表达模式分析)[J].西北植物学报,2022(06):920-929
A类:
BpTrihelix1,BpTrihelix8,BpTrihelix3,BpTrihelix4,BpTrihelix7
B类:
白桦,全基因组鉴定,表达模式分析,植物生长发育,抗逆,逆反应,基因组数据,家族基因,表达特性,功能研究,分子量,Da,等电点,疏水性,组织特异性,特异性表达,表达分析,病原菌侵染,链格孢霉,霉菌,Alternaria,alternata,植株,立枯丝核菌,Rhizoctonia,solani,幼苗,根部,余家,基因表达量
AB值:
0.267101
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