典型文献
核桃CONSTANS-Like基因家族全基因组鉴定及表达分析
文献摘要：
基于核桃基因组鉴定核桃COL(CONSTANS-Like)家族成员,并对其进行分析,以揭示核桃COL家族的分子进化和潜在功能.以'新新2号'(Juglans regia cv.Xinxin No.2)为材料,对COL基因家族全基因组进行鉴定及生物信息分析,并分析其在不同组织及不同时间雌花芽的表达.结果表明,核桃基因组中共存在55个COL基因,不均匀地分布在16个染色体和1个Scaffold上,依次命名为JrCOL1-JrCOL55,氨基酸为117-789 aa,分子量为12.99-86.08 kD,等电点为4.00-8.94,进化树分析将其分为3个亚族,且同一分支基因的保守基序和基因结构位置相似.启动子区的顺式作用元件分析发现JrCOL基因含有大量与光信号、植物激素、胁迫等相关的顺式作用元件.'新新2号'中JrCOL家族基因具有组织特异性表达,其中JrCO1、JrCO7a-c、JrCO8、JrCOL23、JrCO31a-c、JrCO33、JrCOL35和JrCOL50a-f在叶片中表达量最高.对'新新2号'雌花芽不同时间JrCOL基因的RT-qPCR分析表明,JrCOL1、JrCOL35、JrCOL50a-f和JrCOL52在'新新2号'雌花芽中,具有一致的表达趋势,其中JrCOL50a-f在'新新2号'雌花芽分化过程中起到重要作用.在核桃基因组中鉴定出55个COL家族基因,分为3个亚家族,不均匀地分布在16个染色体和1个Scaffold上,结构进化保守,组织表达模式多样.推测JrCOL家族基因在核桃叶片发育过程中发挥重要功能.
文献关键词：
’新新2号’;CONSTANS-Like;核桃基因家族;全基因组鉴定;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
袁星;郭彩华;刘金明;亢超;全绍文;牛建新
作者机构：
石河子大学农学院园艺系特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,石河子 832003
文献出处：
引用格式：
[1]袁星;郭彩华;刘金明;亢超;全绍文;牛建新-.核桃CONSTANS-Like基因家族全基因组鉴定及表达分析)[J].生物技术通报,2022(09):167-179
A类：
Xinxin,JrCOL1,JrCOL55,JrCOL,JrCO1,JrCO7a,JrCO8,JrCOL23,JrCO31a,JrCO33,JrCOL35,JrCOL50a,JrCOL52,核桃基因家族
B类：
CONSTANS,Like,全基因组鉴定,表达分析,分子进化,Juglans,regia,cv,No,生物信息分析,不同组织,雌花,Scaffold,aa,分子量,kD,等电点,进化树分析,保守基序,基因结构,启动子区,顺式作用元件,光信号,植物激素,胁迫,家族基因,有组织,组织特异性,特异性表达,qPCR,花芽分化,亚家族,结构进化,组织表达模式,核桃叶,叶片发育,重要功能
AB值：
0.242617
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