典型文献
桃TGA家族鉴定及BABA诱导的抗病表达分析
文献摘要：
以高度保守的BRLZ (PF07716)和DOG1(PF14144)结构域为种子序列,通过生物信息分析共鉴定得到15个桃TGA (TGACG motif-binding factor)家族基因,这些基因分布于桃的4条染色体上,其编码蛋白大小介于333～546 aa,分子量介于37.07～61.47 kD,等电点介于6.01 ～8.59,均定位于细胞核上.根据系统进化关系,拟南芥、大豆、番茄、水稻和桃的TGA家族分为5个亚族,其中桃TGA家族成员主要分布于第Ⅰ、Ⅱ和Ⅳ亚族.对桃TGA家族成员启动子区域的顺式调控元件进行预测分析,其启动子区含有至少1个激素或逆境胁迫响应元件.经RNA-seq数据分析可知,β-氨基丁酸(β-aminobutyric acid,BABA)处理和匍枝根霉(Rhizopus stolonifer)侵染能诱导桃TGA成员表达,其中PpTGA1-1在处理后12 h内上调最为显著;显著表达的PpTGA1-1通过与PpNPR1蛋白相互作用赋予PpNPR1蛋白DNA结合功能,启动一系列病程相关(pathogenesis-related,PR)基因的表达,从而诱导果实敏化(priming)抗性.桃TGA家族成员(尤其PpTGA1-1)可直接响应激发子诱导和病原菌侵染,并通过修饰PpNPR1蛋白从而在防卫反应中发挥重要调控作用.
文献关键词：
桃;TGA;转录因子;β-氨基丁酸;诱导抗病;敏化;软腐病
中图分类号：
作者姓名：
黎春红;汪开拓;雷长毅;许凤;季娜娜;蒋永波
作者机构：
重庆三峡学院生命科学与工程学院,重庆404000;南京农业大学食品科技学院,南京210095;宁波大学食品科学与工程系,浙江宁波315211
文献出处：
引用格式：
[1]黎春红;汪开拓;雷长毅;许凤;季娜娜;蒋永波-.桃TGA家族鉴定及BABA诱导的抗病表达分析)[J].园艺学报,2022(02):265-280
A类：
PF07716,PF14144,PpTGA1,PpNPR1
B类：
BABA,表达分析,BRLZ,DOG1,结构域,子序列,生物信息分析,TGACG,motif,binding,家族基因,基因分布,编码蛋白,aa,分子量,kD,等电点,细胞核,系统进化,进化关系,拟南芥,大豆,番茄,水稻,启动子区域,顺式调控元件,预测分析,逆境胁迫响应,响应元,seq,氨基丁酸,aminobutyric,acid,匍枝根霉,Rhizopus,stolonifer,蛋白相互作用,pathogenesis,related,敏化,priming,激发子,病原菌侵染,防卫,诱导抗病,软腐病
AB值：
0.400489
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