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典型文献
马尾松NAC转录因子基因PmNAC8的克隆及表达分析
文献摘要:
NAC(NAM,ATAF1/2,CUC2)家族基因参与调控植物生长发育、响应非生物胁迫及激素信号转导.研究马尾松中NAC转录因子在非生物胁迫中的应答,为阐明基因功能提供理论依据.以马尾松(Pinus massoniana)为试验材料,通过RT-PCR及RACE技术克隆一个NAC家族基因,并对其进行生物信息学分析.运用qRT-PCR检测其组织表达特性及对逆境胁迫的响应情况;以基因组DNA为模板,运用染色体步移(genome walking)技术克隆该基因上游启动子序列;通过农杆菌注射本氏烟草(Nicotiana benthamiana),观察其亚细胞定位.该基因全长1726 bp,开放阅读框为1209 bp,编码402个氨基酸,将其命名为PmNAC8,GenBank登录号为MZ291447;亚细胞定位结果显示,该基因定位于细胞核;其密码子使用偏性较弱,偏好使用A/T结尾的密码子,且烟草与酵母更适合作为PmNAC8的异源表达受体;qRT-PCR显示PmNAC8在根部表达量最高,且受机械损伤及植物激素GA、ABA的诱导;克隆获得PmNAC8上游1492 bp的启动子区域,含有多个胁迫诱导元件、赤霉素调控元件和光响应元件.PmNAC8参与多种逆境胁迫,可能在赤霉素信号途径中发挥重要作用.
文献关键词:
马尾松;NAC;密码子偏性;亚细胞定位;非生物胁迫;启动子
作者姓名:
镐青青;姚圣;刘佳禾;陈佩珍;张梦洋;季孔庶
作者机构:
南京林业大学 南方现代林业协同创新中心 林木遗传与生物技术教育部重点实验室,南京 210037
文献出处:
引用格式:
[1]镐青青;姚圣;刘佳禾;陈佩珍;张梦洋;季孔庶-.马尾松NAC转录因子基因PmNAC8的克隆及表达分析)[J].生物技术通报,2022(04):202-216
A类:
PmNAC8,MZ291447
B类:
马尾松,表达分析,NAM,ATAF1,CUC2,家族基因,植物生长发育,非生物胁迫,激素信号,信号转导,基因功能,Pinus,massoniana,RACE,生物信息学分析,qRT,组织表达特性,逆境胁迫,染色体步移,genome,walking,启动子序列,农杆菌,本氏烟草,Nicotiana,benthamiana,亚细胞定位,全长,bp,开放阅读框,GenBank,登录号,定位结果,基因定位,细胞核,密码子使用偏性,好使,结尾,酵母,异源表达,根部,机械损伤,伤及,植物激素,GA,ABA,启动子区域,赤霉素,光响应,响应元,信号途径,密码子偏性
AB值:
0.348902
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