典型文献
天津地区鸡源沙门氏菌的基因分型研究
文献摘要:
目的 研究并评估几种分子分型方法对亲缘关系相近鸡源沙门氏菌的分辨能力.方法 针对2015—2016年从天津市大型市场和超市中分离的106株沙门氏菌及其全基因组测序结果,分析了沙门氏菌的血清型、序列类型(sequence types,STs),并通过脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)、核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence typing,cgMLST)以及一种基于59个基因的分型方法对沙门氏菌进行分子分型研究.结果 106株沙门氏菌共分为8种血清型和8个ST型;PFGE分型方法将沙门氏菌分为7个集群;cgMLST将沙门氏菌分为8个集群;59个基因的分型方法将亲缘关系相近的分离株分为9个集群.结论 肠炎沙门氏菌为这些沙门氏菌中的优势亚型;cgMLST具有最高的分辨率;基于59个基因的分型方法可以满足对亲缘关系相近沙门氏菌的分型研究.
文献关键词:
沙门氏菌;脉冲场凝胶电泳;核心基因组多位点序列分型;功能基因分型
中图分类号:
作者姓名:
王骁;赵处敏;康青;杜婷;李萍;杜欣军;王硕
作者机构:
天津科技大学食品科学与工程学院, 食品营养与安全国家重点实验室, 天津 300457;南开大学医学院, 天津市食品科学与健康重点实验室, 天津 300350
文献出处:
引用格式:
[1]王骁;赵处敏;康青;杜婷;李萍;杜欣军;王硕-.天津地区鸡源沙门氏菌的基因分型研究)[J].食品安全质量检测学报,2022(14):4487-4493
A类:
功能基因分型
B类:
天津地区,分型研究,分子分型,分型方法,亲缘关系,超市,全基因组测序,血清型,sequence,types,STs,脉冲场凝胶电泳,pulsed,field,gel,electrophoresis,PFGE,核心基因组多位点序列分型,core,genome,multilocus,typing,cgMLST,分离株,肠炎沙门氏菌
AB值:
0.254596
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。