典型文献
斑马鱼Hepcidin-2基因结构的生物信息学分析与抗菌活性优化设计
文献摘要：
目的 对斑马鱼Hepcidin-2基因结构进行生物信息学分析,并设计优化其抗菌活性.方法 选取斑马鱼Hepcidin-2作为目的基因,通过Tblastn进行多序列同源性比对得到Hepcidin基因家族的核苷酸和氨基酸序列,利用生物信息学方法分析其进化关系、理化性质、信号肽、跨膜结构、二级结构、三级结构等;收集和筛选多个物种的Hepcidin序列152条,计算成熟肽各个位置最大频率的氨基酸,得到序列模板,并对序列模板进行预测.结果 抗菌肽(antimicrobial peptide,AMP)活性中心空间结构高度保守,C-末端及信号肽区域形成跨膜螺旋结构,成熟肽部分存在β-折叠,得到的序列模板预测具有抗真菌活性,对肺炎克雷伯菌有抗菌活性,对人红细胞有溶血活性.结论 建立了序列模板法优化AMP序列和预测其抗菌活性的技术路线,为改造天然AMP,扩大其在临床和生产中的应用提供了理论支持和技术支撑.
文献关键词：
Hepcidin;斑马鱼;基因结构;生物信息学;抗菌活性;优化设计
中图分类号：
作者姓名：
胡媛媛;刘子琦;乔子祺;陈欣;尹华雯;姚波
作者机构：
重庆科技学院化学化工学院,重庆401331;工业发酵微生物重庆市重点实验室,重庆401331
文献出处：
引用格式：
[1]胡媛媛;刘子琦;乔子祺;陈欣;尹华雯;姚波-.斑马鱼Hepcidin-2基因结构的生物信息学分析与抗菌活性优化设计)[J].中国生物制品学杂志,2022(02):150-158
A类：
Tblastn
B类：
斑马鱼,Hepcidin,基因结构,生物信息学分析,抗菌活性,目的基因,序列同源性,基因家族,氨基酸序列,利用生物,生物信息学方法,进化关系,信号肽,膜结构,二级结构,三级结构,个位,抗菌肽,antimicrobial,peptide,AMP,活性中心,心空,螺旋结构,折叠,抗真菌活性,肺炎克雷伯菌,溶血活性,模板法
AB值：
0.311661
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
