典型文献
深圳市大鹏新区2起儿童疱疹性咽颊炎聚集性疫情的病原鉴定与基因分型分析
文献摘要：
[目的]分析2021年5月深圳市大鹏新区2起儿童疱疹性咽颊炎疫情的病原特征及其基因型.[方法]采集2起疱疹性咽峡炎暴发疫情患儿的5份咽拭子,用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)对其进行常见肠道病毒的基因检测,采用逆转录巢式聚合酶链式反应(RT?nPCR)法扩增肠道病毒VP1区,通过测序和比对进行序列分析,运用MEGA7软件中的CLUSTAL W程序进行位点对齐并构建系统进化树.[结果]引起这2起疱疹性咽峡炎疫情的病原体为柯萨奇病毒A4(CVA4).VP1区基因序列分析发现2起疫情样本之间的核苷酸同源性为92％;A幼儿园的3株毒株与深圳2018株(MN840533)进化关系最近,核苷酸同源性为98.11％;B幼儿园的2株毒株与四川2018株(MW178763)进化关系最近,核苷酸同源性为97.88％.系统进化树显示,本研究的5株CVA4病毒均属C2基因亚型.[结论]2起儿童疱疹性咽颊炎疫情都是由CVA4病毒引起,均属C2基因亚型.
文献关键词：
柯萨奇病毒A4;疱疹性咽颊炎;聚集性疫情;基因型;基因序列;系统进化树
中图分类号：
作者姓名：
黄妙芬;王文祥;连宪强;杨粤
作者机构：
深圳市大鹏新区疾病预防控制中心,广东深圳 518116
文献出处：
引用格式：
[1]黄妙芬;王文祥;连宪强;杨粤-.深圳市大鹏新区2起儿童疱疹性咽颊炎聚集性疫情的病原鉴定与基因分型分析)[J].上海预防医学,2022(07):660-664
A类：
CLUSTAL,MN840533,MW178763
B类：
深圳市大鹏新区,疱疹性咽颊炎,聚集性疫情,病原鉴定,基因分型,病原特征,基因型,疱疹性咽峡炎,暴发疫情,咽拭子,实时荧光聚合酶链式反应,肠道病毒,基因检测,逆转录,nPCR,VP1,MEGA7,对齐,建系,系统进化树,病原体,柯萨奇病毒,CVA4,基因序列分析,同源性,幼儿园,毒株,进化关系,C2,基因亚型
AB值：
0.249915
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