目的:依据肠道病毒分子分型的基本原则（基于 VP1区全长核苷酸序列差异界值15%~25%），科学建立柯萨奇病毒B组5型（coxsackievirus B5，CVB5）的分子分型标准。 方法:本研究依托中国手足口病实验室网络，将来自中国大陆2001—2021年间分离出的69株CVB5采用逆转录－聚合酶链反应扩增全长 VP1编码区，并进行核苷酸序列测定和分析；同时下载并筛选GenBank中截至2022年2月16日的742条CVB5全长 VP1编码区核苷酸序列（849个核苷酸）。使用MEGA 7.0软件进行序列比对及构建基于最大似然法的基因进化树，自展值设定为1 000，进行CVB5分子分型标准的研究。 结果:69株中国大陆CVB5分离株与CVB5原型株（Faulkner株）核苷酸和氨基酸的相似性分别为77.3%~81.6%和93.2%~95.3%。系统进化树显示，全球CVB5可分为4个不同分支，分支内核苷酸的平均差异范围在7.3%~13.4%，氨基酸的平均差异范围在1.9%~3.3%，分支间核苷酸的平均差异范围在17.0%~22.3%，氨基酸的平均差异范围为4.2%~4.9%。根据上述分子分型标准，将全球CVB5划分为A、B、C、D四个基因型。A基因型和C基因型CVB5可能在进化过程中已消失，不再流行，而B基因型和D基因型CVB5目前在全球呈现共流行趋势。中国大陆流行的CVB5主要为D基因型，少部分为B基因型。结论:本研究建立了CVB5的分子分型的标准，并根据该标准将全球CVB5划分为4个基因型，对进一步了解CVB5的遗传变异变迁规律和进行分子溯源具有重要意义。

柯萨奇病毒B组5型;分子分型;VP1区 ;分型标准;手足口病

何云;杨倩;严冬梅;祝双利;冀天娇;卫海燕;魏雷雷;樊欢;路环环;肖金波;赵鹤鹤;王雯慧;郭琴;邢薇佳;张勇

山东第一医科大学　山东省医学科学院，济南　250117;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所　国家脊髓灰质炎实验室　国家卫生健康委员会生物安全重点实验室　国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室，北京　102206;河南省疾病控制预防中心，郑州　450016;吉林省疾病预防控制中心　吉林省公共卫生研究院，长春　130062;江苏疾病控制预防中心　南京　210009

国际病毒学杂志

[1]何云;杨倩;严冬梅;祝双利;冀天娇;卫海燕;魏雷雷;樊欢;路环环;肖金波;赵鹤鹤;王雯慧;郭琴;邢薇佳;张勇-.柯萨奇病毒B组5型基因分型标准的研究)[J].国际病毒学杂志,2022(06):

柯萨奇病毒,基因分型,分型标准,肠道病毒,分子分型,VP1,全长,序列差异,coxsackievirus,CVB5,国手,手足口病,实验室网络,中国大陆,逆转录,聚合酶链反应,编码区,序列测定和分析,时下,下载,GenBank,MEGA,序列比对,最大似然法,基因进化树,自展,分离株,Faulkner,系统进化树,平均差,根据上述,基因型,流行趋势,少部分,准将,遗传变异,异变,变迁规律,分子溯源

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