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一株人轮状病毒G2P[4]型毒株的近似全基因组进化分析
文献摘要:
目的:分析轮状病毒G2P[4]型2020BJ株的近似全基因组进化特征。方法:运用逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)进行轮状病毒基因组扩增,将扩增产物测序,对所得序列进行系统进化和同源性分析。结果:获得人轮状病毒G2P[4]型2020BJ株近似全长的11个节段核酸序列,序列分析表明其为G2-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2基因型(DS-1-Like);进化分析表明与日本、印度、孟加拉及意大利等国家毒株亲缘关系较近;亲缘关系较近的毒株间抗原表位的氨基酸存在差异。结论:与2020BJ亲缘关系较近的5株G2P[4]型轮状病毒VP7和VP4的抗原表位的氨基酸存在差异,可能导致流行特征不同,应加强轮状病毒监测。
文献关键词:
轮状病毒;G2P[4]基因型;全基因组;系统进化树
中图分类号:
作者姓名:
高升辉;李利利;李丹地;朱曦;王萌璇;王明雯;吴建军;李金松
作者机构:
甘肃中医药大学公共卫生学院,兰州 730099;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京 102206
文献出处:
引用格式:
[1]高升辉;李利利;李丹地;朱曦;王萌璇;王明雯;吴建军;李金松-.一株人轮状病毒G2P[4]型毒株的近似全基因组进化分析)[J].中华实验和临床病毒学杂志,2022(04):402-408
A类:
2020BJ
B类:
一株,轮状病毒,G2P,毒株,全基因组,基因组进化,进化分析,进化特征,逆转录,聚合酶链式反应,reverse,transcription,polymerase,chain,reaction,病毒基因组,基因组扩增,扩增产物,同源性分析,全长,节段,序列分析,I2,C2,M2,A2,N2,E2,H2,基因型,DS,Like,孟加拉,意大利,亲缘关系,抗原表位,VP7,VP4,流行特征,系统进化树
AB值:
0.344444
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