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盐城市2018-2019年手足口病和疱疹性咽峡炎病原学特征分析
文献摘要：
目的 探讨盐城市近年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)和疱疹性咽峡炎病原学特征,以及柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)、10型(CVA10)分离株VP1区序列分子进化规律.方法 收集全市哨点监测医院诊断为HFMD和疱疹性咽峡炎病例标本,采用实时荧光RT-PCR进行肠道病毒核酸检测,选取鉴定为CVA4和CVA10阳性标本开展VP1区序列测序,应用生物信息学软件构建系统进化树,分析核苷酸和氨基酸同源性和氨基酸变异位点.结果 2018-2019年,盐城市累计采集和检测1 289份病例标本,总体病毒核酸阳性检出率59.2％,HFMD和疱疹性咽峡炎阳性检出率分别为59.7％和57.1％,差异无统计学意义(x2=0.48,P=0.51);CVA6阳性检出率为31.3％,为优势血清型,EV71型、CVA16型、CVA6型、CVA10型、CVA4型样本阳性检出率差异均有统计学意义(P值均＜0.05).共分离12株CVA4型和31株CVA10型毒株,基因型均为F型和C型;分离毒株间核苷酸同源性分别为99.3％～100.0％和96.0％～100.0％,氨基酸同源性分别为91.3％～100.0％和99.3％～100.0％,亲缘关系较近;分别存在2个和4个氨基酸易变异位点.结论 盐城市2018-2019年HFMD和疱疹性咽峡炎病原体主要为CVA6型肠道病毒;CVA4和CVA10分离株流行基因型分别为F型和C型.
文献关键词：
手足口病;疱疹性咽峡炎;肠道病毒;分子流行病学
中图分类号：
作者姓名：
徐丹;杨薇;姚学君;徐士林;王瑶;陈国清
作者机构：
盐城市疾病预防控制中心,江苏盐城224000
文献出处：
引用格式：
[1]徐丹;杨薇;姚学君;徐士林;王瑶;陈国清-.盐城市2018-2019年手足口病和疱疹性咽峡炎病原学特征分析)[J].江苏预防医学,2022(02):158-162
A类：
B类：
盐城市,手足口病,疱疹性咽峡炎,病原学特征,hand,foot,mouth,disease,HFMD,柯萨奇病毒,Coxsackievirus,CVA4,CVA10,分离株,VP1,分子进化,进化规律,哨点监测,肠道病毒,病毒核酸检测,阳性标本,生物信息学软件,软件构建,建系,系统进化树,同源性,氨基酸变异,变异位点,阳性检出率,炎阳,x2,CVA6,优势血清型,EV71,CVA16,毒株,亲缘关系,别存,易变,病原体,流行基因型,分子流行病学
AB值：
0.295883
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