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广州市柯萨奇病毒A10型VP1区基因特征分析
文献摘要：
目的 了解广州市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中柯萨奇病毒A1(型(coxsackievirus A10,CV-A10)VP1区基因特征.方法 采用荧光RT-PCR法对2017-2020年广州市HFMD病例标本进行检测确定病毒型别.对CV-A10阳性病例流行病学特点进行分析.挑选CV-A10阳性代表样本进行病毒培养和VP1区基因扩增测序,采用DNAstar7.1及Mega 6.0对测序序列进行分析.结果2017-2020年共检测肠道病毒阳性样本8430份,其中CV-A10阳性样本564份(6.69％).CV-A10阳性病例主要集中在5-7月,以5岁以下儿童为主,男女性别比为1.42:1.本研究共获得68株CV-A10毒株VP1区全长序列,对其进行序列分析表明,CV-A10毒株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为90.8％～100％和96.9％～100％,与原型株Kowalik(AF081300)核苷酸和氨基酸同源性为69.8％～71.8％和91.4％～93.8％.分子进化树分析显示,广州市CV-A10毒株均位于C2亚型中的Cluster1和Cluster3 2个分支上.结论 CV-A10是引起广州市HFMD的优势病原体之一,其基因型均为C2亚型,2017-2020年共有2个分支在广州市共同流行.
文献关键词：
手足口病;柯萨奇病毒A10;肠道病毒;系统进化树
中图分类号：
作者姓名：
曾庆;刘静雯;耿进妹;苏文哲;狄飚;谢华萍
作者机构：
广州市疾病预防控制中心,广州510440
文献出处：
引用格式：
[1]曾庆;刘静雯;耿进妹;苏文哲;狄飚;谢华萍-.广州市柯萨奇病毒A10型VP1区基因特征分析)[J].预防医学情报杂志,2022(09):1243-1248
A类：
DNAstar7,Kowalik,AF081300,Cluster3
B类：
柯萨奇病毒,A10,VP1,基因特征分析,手足口病,hand,foot,mouth,disease,HFMD,coxsackievirus,CV,型别,阳性病例,流行病学特点,基因扩增,Mega,肠道病毒,病毒阳性,阳性样本,男女性,性别比,共获,毒株,全长,序列分析,同源性,分子进化树,进化树分析,C2,Cluster1,病原体,基因型,系统进化树
AB值：
0.275441
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