埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)属于B组肠道病毒,是最常见的人类肠道病毒(Enterovirus,EV)之一,是引起无菌性脑膜炎,新生儿感染的重要病原体之一.为探讨广州市生活污水监测中E11分离株循环动态变化及其基因组特征,本研究对2009-2021年广州市生活污水EV监测获得的E11分离株进行VP1区基因扩增及测序,结合2019年广东省发生的两起E11新生儿感染事件及部分散发病例中获得的E11分离株,与全球E11参考株进行序列相似性分析和系统发生学分析.结果显示,2009-2021年生活污水EV监测中E11分离株的核苷酸及氨基酸相似性分别为72.8％～99.3％和84.5％～99.6％.监测发现,广州市2018-2019年在污水中检出大量E11,与两起新生儿感染事件及散发病例的分离株核苷酸相似性高达96.2％～99.2％,但序列间仍存在差异,两起新生儿感染及散发病例感染的毒株为不同来源.通过系统进化树分析发现,2018-2019年污水E11分离株及两起新生儿感染与散发病例E11亲缘关系较近,分子分型结果均为E11 D5基因型.2017年及以前的污水分离株以A1基因型为主,但也有C3和D5基因型,2018年开始则以D5基因型为主,与同时期EV感染病例基因型结果一致.而在2021年污水中则发现了 E11 E基因型,但广州暂未有该基因型的感染病例报道,仍需持续进行病例和环境监测.结果表明,生活污水监测能够及时反映EV在环境和人群中的循环动态变化,对EV引起的相关疾病起到预测预警作用.

埃可病毒11型;污水监测;基因特征;循环动态变化

黄淑芬;张薇;陈美钟;郭雪;祝双利;李彩霞;曾汉日;方苓;张勇;郑焕英;邓小玲

南方医科大学公共卫生学院,广州510515;广东省疾病预防控制中心,广东新发突发传染病防治工作站,广州511430;世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室,国家卫生健康委员会生物安全重点实验室,国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京102206

病毒学报

[1]黄淑芬;张薇;陈美钟;郭雪;祝双利;李彩霞;曾汉日;方苓;张勇;郑焕英;邓小玲-.广州市生活污水中埃可病毒11型循环动态变化及基因特征分析)[J].病毒学报,2022(05):1108-1116

循环动态变化

生活污水,埃可病毒,基因特征分析,Echovirus,E11,肠道病毒,Enterovirus,EV,无菌性脑膜炎,新生儿感染,病原体,污水监测,分离株,基因组特征,VP1,基因扩增,两起,感染事件,相似性分析,系统发生,发生学,毒株,不同来源,系统进化树分析,亲缘关系,分子分型,D5,基因型,水分离,A1,C3,感染病,病例报道,环境监测,相关疾病,预测预警

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