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典型文献
铁皮石斛AP3-3基因及启动子的克隆与分析
文献摘要:
[目的] AP3-3属于MADS-box基因家族B类基因,参与兰科植物花被和唇瓣的形成,克隆该基因并进行启动子分析可以进一步研究该基因的生物学功能及其启动子调控作用机制.[方法] 使用RT-PCR和常规PCR技术克隆铁皮石斛DoAP3-3基因及其启动子序列,进行生物信息学分析,构建启动子缺失片段与GUS基因融合表达载体,农杆菌介导转化铁皮石斛原球茎,进行瞬时表达.[结果] DoAP3-3基因cDNA长度为675 bp,编码蛋白质的分子式为C1129H1803N333O347S12,分子量25.98 kDa,pI为8.71,不稳定性指数40.14,GRAVY为?0.823,不存在跨膜区域,亚细胞定位预测得分为细胞核87.0%、线粒体8.7%、细胞质4.3%.启动子片段长度1885 bp,顺式作用元件含有大量的光响应元件等;3个启动子片段均可驱动GUS基因表达,表达强度为?1885~0 bp>?1604~0 bp>?750~0 bp.[结论] DoAP3-3蛋白具有碱性、亲水性和不稳定性,无跨膜结构域,亚细胞定位于细胞核中.DoAP3-3启动子可能受光照、植物激素、MYB转录蛋白等多个因素调控,具备启动活性,且随启动子缺失长度减少呈现增加趋势.
文献关键词:
铁皮石斛;AP3-3;cDNA;启动子;克隆;序列分析
作者姓名:
王义琴;孙博;何玲;师凯辉;黄鑫;王冬梅;陈宇;臧睿;和凤美
作者机构:
云南农业大学园林园艺学院,云南 昆明 650201
文献出处:
引用格式:
[1]王义琴;孙博;何玲;师凯辉;黄鑫;王冬梅;陈宇;臧睿;和凤美-.铁皮石斛AP3-3基因及启动子的克隆与分析)[J].福建农业学报,2022(05):585-591
A类:
DoAP3,C1129H1803N333O347S12
B类:
铁皮石斛,MADS,box,基因家族,兰科植物,花被,唇瓣,启动子分析,生物学功能,启动子序列,生物信息学分析,GUS,基因融合,融合表达,表达载体,农杆菌介导,化铁,原球茎,瞬时表达,cDNA,bp,编码蛋白,分子式,分子量,kDa,pI,稳定性指数,GRAVY,亚细胞定位,定位预测,细胞核,细胞质,段长度,顺式作用元件,光响应,响应元,亲水性,跨膜结构域,植物激素,MYB,因素调控,启动活性,序列分析
AB值:
0.352511
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