首站-论文投稿智能助手
典型文献
芒果MiAGL80基因特征及表达模式分析
文献摘要:
AGL80/FEM111属于Type I型MADS-box基因家族,调控拟南芥中央细胞及胚乳的发育.目前,AGL80在木本植物中鲜有研究报道.本研究从芒果转录组数据中获得并命名为MiAGL80基因.生物信息学分析表明:MiAGL80基因位于1号染色体上,ORF全长为897 bp,无内含子,编码299个氨基酸,理论等电点为4.95,蛋白质分子量为73.19 kDa,氨基酸序列中含有1个MADS_SRF_like保守结构域.系统进化树分析表明:芒果MiAGL80与阿月浑子PvAGL80最为接近,且同源性最高,氨基酸相似性为64.29%.启动子序列分析显示:芒果MiAGL80基因的启动子包含光响应元件、逆境响应元件、转录因子结合位点以及激素响应元件等,其中光响应元件相较其他元件数量较多,不仅包含光调节相关元件,还包含昼夜节律表达所必需的区域元件;激素响应元件中包括赤霉素响应元件、生长素响应元件和乙烯响应元件;逆境响应元件主要是干旱响应元件.基因表达模式分析显示:在芒果果实中,MiAGL80随着芒果果实的逐渐发育,其在果肉中的表达水平持续下降,在花后100 d的果实与成熟果中的表达水平很低;在种胚发育过程中其表达水平先上升后下降,在花后100 d的胚和成熟胚中表达水平也很低;在种胚萌发发育期,其表达水平再次升高.在成花发育不同时期的组织器官中:MiAGL80主要在叶片中表达,其表达量先降低后逐渐升高,然后再降低,在花器官发育末期达到最大值;在花芽中的表达水平也显著高于营养芽;但在茎中表达量极低,几乎不表达.说明MiAGL80在芒果果实发育、种胚发育、种子萌发以及成花调控方面发挥作用.以上研究结果为深入研究MiAGL80基因的功能提供参考.
文献关键词:
芒果;AGL80;基因特征;表达模式
作者姓名:
曾学梅;何新华;余海霞;黄星;陆婷婷;张艺粒;朱嘉伟;罗聪
作者机构:
广西大学农学院/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广西南宁 530000
文献出处:
引用格式:
[1]曾学梅;何新华;余海霞;黄星;陆婷婷;张艺粒;朱嘉伟;罗聪-.芒果MiAGL80基因特征及表达模式分析)[J].热带作物学报,2022(11):2243-2248
A类:
MiAGL80,AGL80,FEM111,PvAGL80,成花调控
B类:
芒果,基因特征,表达模式分析,Type,MADS,box,基因家族,拟南芥,中央细胞,胚乳,木本植物,转录组数据,生物信息学分析,ORF,全长,bp,内含子,等电点,分子量,kDa,氨基酸序列,SRF,like,保守结构域,系统进化树分析,阿月浑子,同源性,启动子序列,序列分析,光响应,响应元,逆境响应,转录因子结合位点,激素响应,件数,关元,昼夜节律,赤霉素,生长素,干旱响应,基因表达模式,果肉,种胚发育,先上,成熟胚,发育期,花发育,组织器官,先降,再降,花器官发育,花芽,果实发育,种子萌发
AB值:
0.286848
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。