典型文献
苹果SRS基因家族的鉴定与功能分析
文献摘要：
SHI-related sequence(SRS)基因家族通过介导激素变化以调控植物成花及生长发育,并且在适应环境胁迫中起重要调控作用.该研究基于苹果(Malus domestica Borkh.)基因组数据,通过生物信息学手段鉴定苹果SRS基因家族成员,并分析SRS基因家族特点与功能及表达情况.结果表明:(1)苹果MdSRS基因家族共包含11个成员,分别命名为MdSRS1—MdSRS11,不均匀地分布在苹果的9条染色体上.(2)MdSRS蛋白包含229～414个不等的氨基酸残基,等电点分布在6.38～9.36之间;亚细胞定位结果表明,MdSRS蛋白大多分布于细胞膜,在细胞核、叶绿体中也有分布.(3)通过引入拟南芥、水稻、番茄及杨树的SRS基因进行系统发育分析表明,将11个MdSRSs分成5个亚族(A1—A5),在A4中分布最多.(4)顺式作用元件分析表明,11个MdSRSs启动子上游2 000 bp序列分布有激素、环境适应性和逆境诱导等响应元件.(5)荧光定量PCR结果显示,苹果MdSRS基因家族在盐胁迫和干旱胁迫下总体呈下调表达,在ABA胁迫后大多呈上调表达,是具有很大潜力的抗性候选基因,说明SRS家族对ABA调节等非生物胁迫具有调控作用.研究认为,SRS家族的11个成员均参与了调控干旱、盐及ABA胁迫多种逆境的响应,推测在实际苹果生产中对抵御不良环境具有重要作用.
文献关键词：
SRS基因家族;生物学信息分析;表达分析;抗性
中图分类号：
作者姓名：
王锦锋
作者机构：
陇东学院农林科技学院,甘肃庆阳745000
文献出处：
引用格式：
[1]王锦锋-.苹果SRS基因家族的鉴定与功能分析)[J].西北植物学报,2022(06):943-951
A类：
MdSRS,MdSRS1,MdSRS11,MdSRSs
B类：
基因家族,功能分析,SHI,related,sequence,成花,适应环境,环境胁迫,Malus,domestica,Borkh,基因组数据,白包,氨基酸残基,等电点,亚细胞定位,定位结果,细胞膜,细胞核,叶绿体,拟南芥,水稻,番茄,杨树,系统发育分析,A1,A5,A4,顺式作用元件,启动子,bp,环境适应性,逆境,响应元,盐胁迫,干旱胁迫,ABA,候选基因,非生物胁迫,苹果生产,不良环境,生物学信息分析,表达分析
AB值：
0.323715
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