典型文献
甘薯响应蔓割病病原菌侵染的IbWRKY7基因克隆与表达分析
文献摘要:
为探究IbWRKY7基因在甘薯响应蔓割病病原菌侵染过程中的表达模式,以高抗蔓割病品种'鄂薯11,为供试材料,克隆到1个新的WRKY家族基因IbWRKY7,进行生物信息学分析;并对'鄂薯11,和蔓割病敏感品种'栗子香'在蔓割病病原菌侵染后IbWRKY7基因的表达模式进行分析.结果显示,IbWRKY7 的CDS序列全长为945 bp,编码314个氨基酸;推测其编码不稳定的亲水性蛋白,蛋白分子质量为33.92 kU,pI 9.82,含有1个WRKY七肽保守序列和1个C2HC型锌指结构.IbWRKY7基因上游2 000 bp的启动子区域内存在多种类型的顺式作用元件,如植物激素应答元件Myb、胁迫响应元件MYC和MYB等.多序列比对及系统进化树分析结果表明,IbWRKY7蛋白与 日本牵牛花InWRKY7和三裂叶薯ItWRKY7亲缘关系最近.亚细胞定位预测显示IbWRKY7蛋白定位于细胞核.实时荧光定量PCR结果表明,与蔓割病病原菌侵染0 h相比,侵染2、4、12、24、48、72、96和120 h后,'鄂薯11'的IbWRKY7基因表达量均显著提高(P<0.05);而'栗子香'的IbWRKY7基因表达量除侵染24 h外的其他7个时间点均显著高于0 h.侵染2~48 h,'鄂薯11,的IbWRKY7基因表达量显著高于'栗子香'.双因素方差分析结果表明,不同品种和侵染时间点的IbWRKY7 基因表达量均存在显著差异.综上,甘薯IbWRKY7基因上游2 000 bp的启动子区域含有12种激素应答和胁迫应答相关的顺式作用元件.IbWRKY7具有WRKY家族的典型结构特征,属于第Ⅲ类WRKY蛋白,氨基酸序列与同源物种相似度高,进化上高度保守.IbWRKY7基因受蔓割病病原菌侵染诱导表达,且在不同蔓割病抗性的甘薯品种中表达量差异显著.
文献关键词:
甘薯;IbWRKY7;蔓割病;表达模式;基因克隆
中图分类号:
作者姓名:
刘意;刘泓江;陈培茹;杨新笋;雷剑;王连军;柴沙沙;靳晓杰;杨圆圆;程贤亮;焦春海;张文英
作者机构:
长江大学农学院,湖北荆州434025;湖北省农业科学院粮食作物研究所,武汉430064
文献出处:
引用格式:
[1]刘意;刘泓江;陈培茹;杨新笋;雷剑;王连军;柴沙沙;靳晓杰;杨圆圆;程贤亮;焦春海;张文英-.甘薯响应蔓割病病原菌侵染的IbWRKY7基因克隆与表达分析)[J].中国农业大学学报,2022(06):91-99
A类:
IbWRKY7,InWRKY7,ItWRKY7
B类:
蔓割病,病原菌侵染,基因克隆与表达,表达分析,侵染过程,表达模式,高抗,家族基因,生物信息学分析,敏感品种,栗子,CDS,全长,bp,亲水性,分子质量,kU,pI,保守序列,C2HC,锌指,启动子区域,多种类型,顺式作用元件,植物激素,激素应答,Myb,胁迫响应,响应元,MYC,MYB,多序列比对,系统进化树分析,牵牛花,三裂叶薯,亲缘关系,亚细胞定位,定位预测,蛋白定位,细胞核,基因表达量,双因素方差分析,不同品种,胁迫应答,氨基酸序列,诱导表达,甘薯品种
AB值:
0.246518
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