典型文献
基于生物信息学探索高危原发性胆汁性胆管炎患者潜在发病机制及治疗靶点
文献摘要：
目的:探索对高危原发性胆汁性胆管炎(PBC)患者可能的发病机理和潜在治疗靶点.方法:从GEO数据下载PBC患者基因表达文件,使用生物信息学分析高危PBC患者差异表达基因(DEGs).运用R语言进行差异表达基因和加权基因共表达网络分析(WGCNA)交集基因的筛选,对其进行功能分析、蛋白质相互作用网络分析(PPI),并使用cytoscape进行网络可视化,用MCC法筛选出排名前10的关键基因.结果:与健康对照和低风险组相比,高危PBC患者共鉴定出44个上调及54个下调DEGs.通过GO分析发现高危PBC患者中存在多种免疫途径异常应答,包括白细胞增殖、B细胞活化、T细胞活化和补体激活等.排名前10的关键基因中,上调DEGs分别为CD44、CD34、CTLA4、ITGA4、CD24、THY1、MAPK3、VEGFC、PDGFRB、ITGB4,下调DEGs分别为C3、C4B、CFP、MBL2、C1R、C1S、C5、C9、C8B、C6,这些关键基因分别与T细胞活化、白细胞增殖及补体激活途径相关.结论:高危PBC患者存在多种免疫途径的异常应答,上述关键基因可能是潜在的治疗靶点,同时靶向补体成分可能是PBC治疗的选择之一.
文献关键词：
原发性胆汁性胆管炎;高危;生物信息学;发病机制;治疗靶点
中图分类号：
作者姓名：
龙林竞;刘丽玉;曲红光;黄建伟
作者机构：
广州医科大学附属第五医院消化内科,广东 广州510799
文献出处：
引用格式：
[1]龙林竞;刘丽玉;曲红光;黄建伟-.基于生物信息学探索高危原发性胆汁性胆管炎患者潜在发病机制及治疗靶点)[J].广州医科大学学报,2022(06):14-21
A类：
ITGA4,C4B,C1R,C8B
B类：
原发性胆汁性胆管炎,治疗靶点,PBC,发病机理,潜在治疗,GEO,数据下载,生物信息学分析,差异表达基因,DEGs,加权基因共表达网络分析,WGCNA,交集,功能分析,蛋白质相互作用网络,PPI,cytoscape,网络可视化,MCC,关键基因,低风险组,免疫途径,细胞活化,补体激活,CD44,CD34,CTLA4,CD24,THY1,MAPK3,VEGFC,PDGFRB,ITGB4,C3,CFP,MBL2,C1S,C5,C9,C6,补体成分
AB值：
0.322395
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