典型文献
miR-203a-3p.1调控VCAN作为胃癌潜在治疗靶点的生物信息学研究
文献摘要：
目的 采用生物信息学技术探讨胃癌发生及进展的机制.方法 采用GEO分析数据集GSE54129中胃癌组织标本与正常胃黏膜组织标本的差异表达基因(DEGs),然后用DAVID数据库对DEGs进行富集分析,STRING构建蛋白质相互作用(PPI)网络,Cytoscape软件可视化,MCODE和cytoHubba筛选关键基因,并在GEPIA数据库及胃癌组织标本中验证关键基因,之后用Target Scan7.2数据库预测调控靶基因的miRNAs.结果 共筛选出630个DEGs(305个上调基因及325个下调基因),富集分析结果提示DEGs主要参与细胞外基质组织形成、蛋白质细胞外基质、肝素结合、化学致癌信号通路.进一步构建PPI网络,利用Cytoscape7.2数据库进行可视化分析,最终确定3个关键DEGs,包括VCAN、IGFBP7、FSTL1.利用GEPIA数据库验证关键DEGs,结果证实VCAN在胃癌组织中高表达(P<0.05),并与胃癌患者的不良预后有关.Target Scan7.2数据库预测结果提示has-miR-203a-3p.1可与VCAN mRNA的3′UTR结合.结论 has-miR-203a-3p.1调控的VCAN是胃癌潜在治疗靶点.
文献关键词：
胃癌;VCAN;miR-203a-3p.1;差异表达基因;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
智鹏柯;石见;周博;杨言通;陈晔
作者机构：
河南科技大学第一附属医院 胃肠肿瘤外科,河南洛阳471003;河南科技大学第一附属医院 神经内科,河南洛阳471003
文献出处：
引用格式：
[1]智鹏柯;石见;周博;杨言通;陈晔-.miR-203a-3p.1调控VCAN作为胃癌潜在治疗靶点的生物信息学研究)[J].检验医学与临床,2022(14):1882-1885,1890
A类：
Scan7,Cytoscape7
B类：
203a,3p,VCAN,潜在治疗,治疗靶点,生物信息学研究,生物信息学技术,技术探讨,GEO,GSE54129,胃癌组织,组织标本,胃黏膜,差异表达基因,DEGs,DAVID,富集分析,STRING,蛋白质相互作用,PPI,MCODE,cytoHubba,选关,关键基因,GEPIA,Target,测调,调控靶基因,miRNAs,细胞外基质,组织形成,肝素,致癌,IGFBP7,FSTL1,胃癌患者,不良预后,has,UTR
AB值：
0.318497
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
