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基于生物信息学分析老年骨质疏松差异表达基因及m6A相关蛋白的研究
文献摘要:
目的 通过生物信息学方法探讨老年骨质疏松相关基因表达谱及m6A相关蛋白基因表达.方法 检索GEO数据库获得数据集,使用R语言软件分析获得差异表达基因?(DEGs)?并进行基因本体论?(GO)?及京都基因和基因组数据库?(KEGG)分析.筛选有表达差异的m6A甲基化相关蛋白,获得差异表达谱.构建蛋白相互作用?(PPI)?网络,计算DEGs的连接度并分析和筛选网络集簇模块,根据degree值筛选核心靶点.结果 本研究共获得292个DEGs.对其进行GO分析发现DEGs富集中存在骨化过程的富集.在20个候选m6A蛋白中筛选得到8个基因并获得其差异表达特征.通过PPI网络分析筛选出2个网络集簇模块,并得到10个关键基因.结论 本研究获得了相关基因富集的通路及生物学过程,筛选出有差异表达的m6A相关蛋白基因表达谱,并通过PPI网络筛选出关键基因,为老年骨质疏松症的相关研究提供了新思路.
文献关键词:
老年骨质疏松;生物信息学;基因表达谱;m6A
中图分类号:
作者姓名:
周子墨;陈佳慧;陈森相;覃森;黄瑛;柳达
作者机构:
中国医科大学附属盛京医院 骨科,沈阳 110004;中国医科大学附属盛京医院 超声科,沈阳 110004
文献出处:
引用格式:
[1]周子墨;陈佳慧;陈森相;覃森;黄瑛;柳达-.基于生物信息学分析老年骨质疏松差异表达基因及m6A相关蛋白的研究)[J].中国医科大学学报,2022(11):975-979,986
A类:
B类:
生物信息学分析,差异表达基因,m6A,生物信息学方法,相关基因表达,基因表达谱,GEO,得数,DEGs,基因本体论,京都,基因组数据,表达差异,甲基化,蛋白相互作用,PPI,连接度,degree,核心靶点,共获,骨化,选得,表达特征,关键基因,基因富集,生物学过程,老年骨质疏松症
AB值:
0.25628
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