典型文献
利用ceRNA网络研究2型糖尿病周围神经病变的相关基因
文献摘要：
目的 探索有关2型糖尿病周围神经病变(DPN)的ceRNA网络调控机制,研究其发病机制及相关治疗靶点.方法 从GEO数据库下载GSE95849数据集.将矩阵文件探针名重注释为基因名,添加基因属性以区分mRNA和lncRNA.运用R语言分析2型糖尿病不伴周围神经病变患者与2型DPN患者外周血的差异lncRNA与差异mRNA.预测差异lncRNA相关的miRNA及mRNA,与差异mRNA取交集,从而得到lncRNA-miRNA-mRNA网络,分析ceRNA网络中mRNA的功能与相关通路,使用STRING数据库分析蛋白互作关系,筛选关键蛋白互作模块.结果 2型DPN与不伴周围神经病变中差异ln-cRNA与mRNA竞争miRNA,从而调控蛋白合成,最终影响丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、转化生长因子(TGF)-β信号传导途径等,发现了5种途径可能是DPN的发病机制:通过上调肌醇-四磷酸(ITPK)1-激酶反义RNA(AS)1以下调hsa-miR-17-5最终上调热休克蛋白(HSP)A8;通过上调C20orf197以下调hsa-miR-20b-5p最终上调HSPA8;通过上调C20orf197以下调hsa-miR-129-5p,最终上调残疾基因同源物(DAB)2;通过上调MIR600HG以下调hsa-miR-129-5p,最终上调DAB2;通过上调ITPK1-AS1以下调hsa-miR-129-5p,最终上调DAB2.HSPA8、DAB2在DPN中起到重要作用,而C20orf197、ITPK1-AS1两种lncRNA在DPN发生中同时调控HSPA8及DAB2蛋白,起到关键作用.结论 发现了5种lncRNA-miRNA-mRNA调节机制与2型DPN有关.
文献关键词：
2型糖尿病周围神经病变(DPN);ceRNA;lncRNA;miRNA;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
辛宁;李小明
作者机构：
福建医科大学省立临床医学院,福建 福州 350001;福建省立医院老年科;福建省老年病研究所
文献出处：
引用格式：
[1]辛宁;李小明-.利用ceRNA网络研究2型糖尿病周围神经病变的相关基因)[J].中国老年学杂志,2022(10):2345-2351
A类：
GSE95849,ITPK,C20orf197,MIR600HG,ITPK1
B类：
ceRNA,糖尿病周围神经病变,DPN,调控机制,治疗靶点,GEO,下载,lncRNA,语言分析,miRNA,交集,相关通路,STRING,数据库分析,蛋白互作,互作关系,选关,关键蛋白,调控蛋白,蛋白合成,丝裂原活化蛋白激酶,MAPK,转化生长因子,TGF,信号传导,传导途径,肌醇,反义,hsa,热休克蛋白,20b,5p,HSPA8,残疾,DAB2,AS1,调节机制
AB值：
0.196132
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