典型文献
缺血性脑卒中差异表达基因筛选、功能富集与相关信号通路生物信息学分析
文献摘要：
目的:探寻缺血性脑卒中(IS)差异表达基因及其相关功能和信号通路.方法:GEO数据库中选取IS患者与正常人群外周血中差异表达基因谱数据,并对差异表达基因进行筛选.对筛选出的差异基因进行聚类,并进行KEGG和蛋白相互作用网络(PPI)分析.结果:三个IS差异表达数据集GSE22255、GSE98319和GSE66724中IS患者和正常对照人群差异表达基因分别为30个、196个和13个.其中共差异表达基因3个分别为STAT3、MMP9和SOCS3.STAT3、MMP9和SOCS3等差异表达基因在缺血性脑卒中组聚类明显;STAT3、MMP9和SOCS3基因编码蛋白拓扑网络富集明显(P<0.05);功能分析,STAT3、MMP9和SOCS3等蛋白主要富集于细胞质、Cul5-RING泛素连接酶复合物等;生物学功能主要富集于蛋白结合、非膜跨越蛋白酪氨酸激酶活性、RNA聚合酶ii特异性DNA结合转录因子结合等;分子功能主要富集于细胞表面受体信号通路、白细胞介素-6的细胞反应和细胞对氧化应激的反应等;STAT3、MMP9和SOCS3基因信号通路为Jak-STAT信号通路、凋亡通路和MAPK.结论:STAT3、MMP9和SOCS3可能与IS发生有关,并有望成为IS预防和治疗的新靶点.
文献关键词：
缺血性脑卒中;生物信息;差异表达;信号通路
中图分类号：
作者姓名：
武金燕
作者机构：
天津市静海区医院 天津医科大学静海临床学院神经内科 301600
文献出处：
引用格式：
[1]武金燕-.缺血性脑卒中差异表达基因筛选、功能富集与相关信号通路生物信息学分析)[J].医学理论与实践,2022(15):2636-2639
A类：
GSE22255,GSE98319,GSE66724,Cul5
B类：
缺血性脑卒中,差异表达基因,基因筛选,功能富集,生物信息学分析,IS,相关功能,GEO,正常人,谱数据,差异基因,蛋白相互作用网络,PPI,正常对照,照人,STAT3,MMP9,SOCS3,基因编码,编码蛋白,拓扑网络,功能分析,细胞质,RING,泛素连接酶,复合物,生物学功能,蛋白结合,蛋白酪氨酸激酶,激酶活性,ii,细胞表面,基因信号通路,Jak,凋亡通路,MAPK,预防和治疗,新靶点
AB值：
0.247691
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