典型文献
不吸烟非小细胞肺癌患者发病潜在关键基因鉴别
文献摘要：
目的 鉴别导致不吸烟非小细胞肺癌(NSCLC)患者发病的关键基因.方法 通过检索GEO数据库,选取两个不吸烟NSCLC患者基因表达谱数据集作为研究对象,使用GEO2R差异基因分析工具获得差异表达基因(DEGs),然后利用DAVID数据库对DEGs进行GO及KEGG富集分析.将DEGs输入到STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,将PPI网络信息导入到Cytoscape软件,基于MCC算法鉴别引起NSCLC发病的关键基因.最后,利用Kaplan Meier plotter和GEPIA在线生存分析工具对所鉴别的关键基因进行生存分析,研究这些基因高表达对NSCLC患者生存时间的影响.结果 分别对两个基因表达谱进行差异表达分析对差异基因取交集,共获得1022个DEGs,其中上调DEGs 343个、下调DEGs 679个.GO与KEGG富集分析表明这些DEGs显著富集于一系列与肿瘤发生发展相关的生物学过程、细胞组分、分子功能及信号转导通路.基于MCC算法选取连接度值排名前10的基因为关键基因,分别是CDK1、CCNB1、BUB1B、CCNB2、AURKA、MAD2L1、CDC20、CCNA2、BUB1、NCAPG.生存分析表明上述关键基因高表达与患者生存时间降低显著相关(P<0.05).结论 共鉴别出不吸烟NSCLC患者发病相关的10个关键基因,其中NCAPG可能是新的NSCLC发病关键基因,这些基因过表达与患者生存时间缩短显著相关,可为NSCLC治疗药物的开发提供新的潜在靶点.
文献关键词：
不吸烟;非小细胞肺癌;关键基因
中图分类号：
作者姓名：
黄河;李成长;彭燕;姜洪波
作者机构：
新乡市中心医院(新乡医学院第四临床学院)呼吸与危重症医学科一,河南 新乡 453000;新乡医学院基础医学院生理学与疾理生理系;新乡医学院第三附属医院营养科
文献出处：
引用格式：
[1]黄河;李成长;彭燕;姜洪波-.不吸烟非小细胞肺癌患者发病潜在关键基因鉴别)[J].中国老年学杂志,2022(13):3170-3174
A类：
B类：
不吸烟,非小细胞肺癌,肺癌患者,关键基因,NSCLC,基因表达谱,谱数据,GEO2R,差异基因分析,差异表达基因,DEGs,DAVID,富集分析,STRING,数据库构建,蛋白互作,PPI,导入到,Cytoscape,MCC,Kaplan,Meier,plotter,GEPIA,生存分析,生存时间,差异表达分析,交集,共获,肿瘤发生发展,生物学过程,信号转导通路,连接度,CDK1,CCNB1,BUB1B,CCNB2,AURKA,MAD2L1,CDC20,CCNA2,NCAPG,基因过表达,治疗药物,潜在靶点
AB值：
0.335442
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