典型文献
基于生物信息学分析鉴定阿尔茨海默病中关键差异表达基因及其潜在治疗靶点
文献摘要：
目的 利用生物信息学方法挖掘阿尔茨海默病(AD)的基因表达谱,筛选出与该病发生发展相关的关键基因.方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载数据集GSE132903,利用R语言进行分析,鉴定出差异表达基因(DEGs),利用DAVID数据库对差异基因进行GO与KEGG功能富集分析,利用string数据库对差异表达基因进行蛋白互作网络分析,随后利用Cytoscape软件中的插件cytohubba进行关键基因筛选.结果 在AD的基因表达谱中鉴定了319个差异表达基因.其中上调基因118个,下调基因201个,与正常对照组样本相比,AD患者样本中神经活动配体-受体相互作用、GABA能突触、突触囊泡循环、长程增强效应等通路显著改变.基于多种算法得到关键基因分别是:SNAP25、SYP、SYT1、SYT4,其中SYT4在AD中的作用机制尚未有报道.结论 利用生物信息学方法成功构建了在AD中起关键作用的蛋白互作网络,发现了4个与疾病相关的关键基因,进一步证明了突触功能在AD中的重要作用,其中SYT4可能是AD治疗的新靶点.
文献关键词：
阿尔茨海默病;生物信息学;差异表达基因;关键基因
中图分类号：
作者姓名：
范加琳;来贺欢;李荷;李欢欢;周海云;吴绍长
作者机构：
丽水市第二人民医院,浙江 丽水 323000;丽水市中心医院
文献出处：
引用格式：
[1]范加琳;来贺欢;李荷;李欢欢;周海云;吴绍长-.基于生物信息学分析鉴定阿尔茨海默病中关键差异表达基因及其潜在治疗靶点)[J].中国老年学杂志,2022(18):4470-4473
A类：
SYT1,SYT4
B类：
生物信息学分析,分析鉴定,阿尔茨海默病,差异表达基因,潜在治疗,治疗靶点,利用生物,生物信息学方法,AD,基因表达谱,基因表达综合数据库,GEO,下载数据,GSE132903,出差,DEGs,DAVID,差异基因,功能富集分析,string,蛋白互作网络分析,Cytoscape,插件,cytohubba,关键基因筛选,正常对照,GABA,突触囊泡,长程,程增强,增强效应,SNAP25,SYP,疾病相关,突触功能,新靶点
AB值：
0.304481
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