典型文献
基于生物信息学技术筛选哮喘严重程度相关核心基因
文献摘要：
目的 研究筛选与哮喘严重程度相关的核心基因.方法 从GEO数据库中下载哮喘患者及健康对照的支气管活检组织测序基因表达谱(GSE147878)数据集,使用GEO2R在线分析工具筛选与哮喘相关的显著差异表达基因,应用R语言中的WGCNA包分析得出与哮喘严重程度密切相关的共表达基因模块,提取相应基因模块中的基因,进行KEGG信号通路富集分析,同时导入STRING数据库进行蛋白质相互作用网络分析,最后用Cytoscape软件中的Cytohubba插件筛选出核心基因.结果 应用多种生物信息学技术筛选出10个可能与哮喘严重程度相关的核心基因:EP300、AKT1、AR、YY1、CEBPA、CREB1、NR3C1、BRD4、POLR2A、CHD8.结论 应用多种生物信息学技术筛选获得了与哮喘严重程度评估相关的核心基因,为哮喘的发生发展机制研究提供新的参考.
文献关键词：
哮喘;加权基因共表达网络分析;差异基因;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
胡鹏;牟密;范皎;徐国纲
作者机构：
100089 北京,解放军总医院第二医学中心健康医学科
文献出处：
引用格式：
[1]胡鹏;牟密;范皎;徐国纲-.基于生物信息学技术筛选哮喘严重程度相关核心基因)[J].中华临床免疫和变态反应杂志,2022(06):595-603
A类：
GSE147878,POLR2A,CHD8
B类：
生物信息学技术,技术筛选,核心基因,下载,哮喘患者,活检组织,基因表达谱,GEO2R,在线分析工具,差异表达基因,言中,WGCNA,包分析,共表达基因,信号通路富集,通路富集分析,STRING,蛋白质相互作用网络,Cytoscape,Cytohubba,插件,EP300,AKT1,YY1,CEBPA,CREB1,NR3C1,BRD4,严重程度评估,发展机制,加权基因共表达网络分析,差异基因
AB值：
0.347003
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