典型文献
斑鸠霉素调节PANC-1细胞系的糖酵解过程
文献摘要：
目的 胰腺癌是恶性腹部肿瘤,以5年生存率奇低,致死率非常高为特征.文章基于生物信息学方法挖掘生物医学数据库数据,识别Ikarugamycin(斑鸠霉素)作用于胰腺导管腺癌(PDAC)的潜在靶标基因.方法 从基因表达汇编(GEO)数据库中下载数据集GSE120713,通过R软件对数据进行校正并鉴定差异表达基因(DEGs),绘制火山图和热图,并对鉴定出的DEGs进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析.然后,利用STRING网站和Cytoscape软件对DEGs进行蛋白质相互作用分析,借助Cytohubba插件识别出10个hub基因.最后,分别在GEPIA2和Kaplan-Meier Plotter网站上验证这些hub基因的表达及预后情况.结果 GEPIA2和Kaplan-Meier Plotter的结果提示:DDIT3、GADD45A、LOX、MMP1、SERPINE1和TXNIP同时满足在PC中表达及预后均有统计学意义,被确定为hub基因.结论 斑鸠霉素可能通过下调DDIT3或LOX的表达,参与PANC-1细胞系糖酵解过程,从而发挥对PANC-1细胞的抑制作用,该研究有助于发现斑鸠霉素治疗PDAC的潜在机制.
文献关键词：
胰腺导管腺癌;斑鸠霉素;生物信息学分析;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
陈辉;曾陶飞;厉泽宇;王怀涛;周磊;谭晓冬
作者机构：
110000 沈阳,中国医科大学附属盛京医院普通外科
文献出处：
引用格式：
[1]陈辉;曾陶飞;厉泽宇;王怀涛;周磊;谭晓冬-.斑鸠霉素调节PANC-1细胞系的糖酵解过程)[J].医学研究与战创伤救治,2022(02):147-153
A类：
斑鸠霉素,Ikarugamycin,GSE120713
B类：
PANC,细胞系,糖酵解,胰腺癌,腹部肿瘤,致死率,生物信息学方法,生物医学数据库,胰腺导管腺癌,PDAC,靶标基因,基因表达汇编,GEO,下载数据,差异表达基因,DEGs,火山图,热图,信号通路富集,通路富集分析,STRING,Cytoscape,蛋白质相互作用,相互作用分析,Cytohubba,插件,GEPIA2,Kaplan,Meier,Plotter,站上,预后情况,DDIT3,GADD45A,LOX,MMP1,SERPINE1,TXNIP,潜在机制,生物信息学分析
AB值：
0.316249
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
