典型文献
MiR-4772通过调控卵巢癌免疫相关基因改变肿瘤免疫微环境
文献摘要：
目的 运用生物信息学分析miR-4772对卵巢癌肿瘤免疫微环境的影响,并深入挖掘其潜在作用机制.方法 基于TCGA数据库的294例卵巢癌患者数据,计算并获得肿瘤组织PD-L1表达最佳阈值;筛选PD-L1高、低表达组之间的差异表达基因(DEG),采用相关性分析获得重要DEG,运用WGCNA分析从DEG筛选出权重基因和PD-L1相关miRNA,重要DEG和权重基因交集获得核心基因;通过ssGSEA分析探讨PD-L1表达和miR-4772表达对卵巢癌肿瘤免疫格局的影响;KEGG法分析核心基因所涉及的信号通路;PPI网络分析核心基因相互作用;采用生存分析确定生存相关的核心基因.采用GEO数据库的399例卵巢癌患者数据,结合miR-4772模拟物和抑制物转染SKOV3细胞并进行基因表达谱测序验证.结果 卵巢癌肿瘤组织PD-L1表达最佳阈值1.31582,即90％分位数;基于PD-L1高、低表达组,筛选出840个差异表达基因,包括549个基因显著上调,291个基因显著下调,20个重要DEG与miR-4772表达密切相关;WGCNA分析筛选48个miR-4772表达相关的权重基因;12个核心基因共存于重要DEG和权重基因.ssGSEA分析显示,PD-L1和miR-4772高表达组展现更活跃的肿瘤组织免疫浸润和功能活性.KEGG功能分析结果显示12个核心基因主要涉及免疫相关信号通路,PPI分析显示12个核心基因存在密切相互作用,CD96和TBX21表达水平与卵巢癌患者生存预后密切相关.SKOV3细胞转染miR-4772模拟物和抑制物后,基因表达谱测序结果显示12个核心基因和PD-L1表达水平随着miR-4772表达水平变化出现相应改变.结论 miR-4772通过作用于12个核心基因,对卵巢癌肿瘤免疫微环境结构组成发挥调控作用.
文献关键词：
卵巢癌;肿瘤免疫微环境;miR-4772;PD-L1表达最佳阈值
中图分类号：
作者姓名：
赵爱月;苏云霞;傅德强
作者机构：
福建医科大学附属第二医院肿瘤内科,福建 泉州 362000
文献出处：
引用格式：
[1]赵爱月;苏云霞;傅德强-.MiR-4772通过调控卵巢癌免疫相关基因改变肿瘤免疫微环境)[J].南方医科大学学报,2022(11):1638-1645
A类：
CD96
B类：
MiR,免疫相关基因,肿瘤免疫微环境,生物信息学分析,癌肿,潜在作用,TCGA,卵巢癌患者,患者数据,肿瘤组织,L1,最佳阈值,低表达,差异表达基因,DEG,WGCNA,miRNA,交集,核心基因,ssGSEA,PPI,生存分析,GEO,抑制物,SKOV3,基因表达谱,分位数,免疫浸润,功能活性,功能分析,免疫相关信号通路,TBX21,生存预后,细胞转染,表达水平变化,结构组成
AB值：
0.218142
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
