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基于生物信息学分析探讨类风湿关节炎与骨关节炎之间的关系
文献摘要：
目的:利用生物信息学分析探讨类风湿关节炎(RA)与骨关节炎(OA)之间的关系.方法:通过GEO数据库获取RA和OA血清基因芯片表达谱,筛选两者之间的差异miRNA并取交集,利用FunRich软件对交集miRNA进行转录因子预测及功能富集分析.应用String及Cytoscape软件对交集miRNA作用的靶基因进行蛋白互作网络构建,并筛选出核心mRNA,最后利用DAVID数据库对mRNA进行GO功能分析及KEGG信号通路分析.结果:共获得hsa-miR-4281、hsa-miR-98-5p、hsa-miR-3613-3p及hsa-miR-6858-3p 4个差异miRNA,其生物过程主要涉及肽代谢、转录、翻译等,涉及10个核心转录因子:LHX3、SP4、NFIC、VSX2、HOXA7、TCF3、MYC、HOXB4、ETS1、SP1.蛋白互作分析提示CDC5L、HNRNPU、GATAD2A、CHD4、ACTB为互作网络中的核心靶点;GO富集分析结果显示交集miRNA所调控mRNA的生物学过程主要涵盖mRNA代谢过程的调控、细胞周期过程的负调控、有丝分裂细胞周期等,KEGG富集结果信号通路主要涉及调控干细胞多能性的信号通路、Hippo信号通路、FoxO信号通路、Apelin信号通路、p53信号通路等.结论:RA与OA两者之间交集miRNA和核心基因的发现有助于了解两种疾病发病机制的相关性,为治疗两种疾病的共同药物研发及治疗方式提供一定的参考.
文献关键词：
类风湿关节炎;骨关节炎;生物信息学;微小核糖核苷酸;信号通路
中图分类号：
作者姓名：
章晓云;李华南;陈锋;柴源;甘斌;陈丁鹏
作者机构：
江西中医药大学,南昌33000;广西中医药大学附属瑞康医院骨科,南宁530011
文献出处：
引用格式：
[1]章晓云;李华南;陈锋;柴源;甘斌;陈丁鹏-.基于生物信息学分析探讨类风湿关节炎与骨关节炎之间的关系)[J].中国免疫学杂志,2022(08):903-908,914
A类：
NFIC,VSX2,HOXA7,HOXB4,CDC5L,GATAD2A,CHD4
B类：
生物信息学分析,类风湿关节炎,骨关节炎,利用生物,RA,OA,GEO,清基,基因芯片,表达谱,miRNA,交集,FunRich,功能富集分析,String,Cytoscape,靶基因,蛋白互作网络,网络构建,DAVID,功能分析,通路分析,共获,hsa,5p,3p,生物过程,LHX3,SP4,TCF3,MYC,ETS1,SP1,蛋白互作分析,HNRNPU,ACTB,核心靶点,生物学过程,代谢过程,细胞周期,负调控,有丝分裂,分裂细胞,集结,Hippo,FoxO,Apelin,p53,核心基因,疾病发病机制,药物研发,微小核糖核苷酸
AB值：
0.344935
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