典型文献
生物信息学分析导致类风湿关节炎性别差异的关键基因与信号通路
文献摘要:
目的:通过生物信息技术分析探讨类风湿关节炎(RA)发病机制中性别间生物学差异的关键基因和通路.方 法:从GEO数据库中获取GSE55457、GSE55584、GSE12021中正常男女性滑膜样本和RA男女性患者滑膜样本的基因表达数 据,将数据整合并使用R软件对差异表达基因(DEGs)进行鉴定.使用在线工具DAVID数据库对DEGs进行GO分析和KEGG 分析.使用Cytoscape 3.6.0构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),并进行模块分析.结果:男性组高表达基因416个, 低表达基因336个,女性组高表达基因744个,低表达基因309个.在男性RA发病中,IL-6、MYC、EGFR、FOS和JUN被认为是 关键基因;在女性RA发病中,IL-6、ALB、PTPRC、CXCL8和CCR5被认为是关键基因.结论:生物信息学分析筛选出的差异基 因分别参与男性和女性RA疾病进展的不同机制,为RA发病机制的探究提供了理论依据.
文献关键词:
类风湿关节炎;差异表达基因;蛋白质-蛋白质相互作用网络;性别差异
中图分类号:
作者姓名:
苏思维;姜雯君;王晓颖;杜森;宋洪强
作者机构:
山东第一医科大学暨山东省医学科学院,运动医学研究所,泰安271000
文献出处:
引用格式:
[1]苏思维;姜雯君;王晓颖;杜森;宋洪强-.生物信息学分析导致类风湿关节炎性别差异的关键基因与信号通路)[J].中国免疫学杂志,2022(21):2628-2633
A类:
GSE55584
B类:
生物信息学分析,类风湿关节炎,性别差异,关键基因,生物信息技术,RA,GEO,GSE55457,GSE12021,中正,男女性,滑膜,女性患者,数据整合,差异表达基因,DEGs,DAVID,Cytoscape,蛋白质相互作用网络,PPI,高表达基因,低表达,MYC,EGFR,FOS,JUN,ALB,PTPRC,CXCL8,CCR5,疾病进展
AB值:
0.294591
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