典型文献
探讨哮喘和SARS-CoV-2的相互作用关系的生物信息学分析
文献摘要：
目的 采用生物信息学方法探讨哮喘和SARS-CoV-2感染的相互作用关系及发生的潜在机制,为哮喘和新冠肺炎(COVID-19)进一步治疗提供新线索.方法 本文使用的研究数据来源于GEO数据库.利用R语言和Perl语言对数据进行预处理,筛选差异表达基因(DEGs),并获得GO功能富集分析、KEGG、Reactome、WikiPathways和BioCarta通路富集分析.通过Cytoscape软件获得蛋白质相互作用(PPI)网络分析可视化结果.使用RegNetwork数据库筛选与DEGs相互作用的转录因子(TF),再利用NetworkAnalyst构建miRNA-TF-mRNA共调控网络.最后,从DSigDB数据库筛选治疗药物.结果 获得哮喘和SARS-CoV-2感染的数据集并且筛选得到25个受两者影响的重叠DEGs.GO功能富集分析和通路富集分析显示,DEGs参与病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体、补体和凝血级联反应通路.miRNA-TF-mRNA共调控网络表明关键基因与相关miRNA和TF之间复杂的调控关系.筛选到作用于DEGs的可能药物分子,包括雷洛昔芬、他莫昔芬和孕酮等.结论 在数据分析的基础上,找出哮喘与SARS-CoV-2感染的共同切入点,为分析SARS-CoV-2在肺部疾病中的作用提供了新思路.
文献关键词：
SARS-CoV-2;哮喘;差异表达基因;蛋白-蛋白互作;药物分子
中图分类号：
作者姓名：
李婧铱;李宾;訾晓琳;李晓霞;赵炜明
作者机构：
齐齐哈尔医学院,黑龙江 齐齐哈尔 161006;哈尔滨医科大学附属第四医院检验科,黑龙江 哈尔滨 150001;哈尔滨医科大学附属第四医院肿瘤内科,黑龙江 哈尔滨 150001;黑龙江中医药大学,黑龙江 哈尔滨 150040
文献出处：
引用格式：
[1]李婧铱;李宾;訾晓琳;李晓霞;赵炜明-.探讨哮喘和SARS-CoV-2的相互作用关系的生物信息学分析)[J].标记免疫分析与临床,2022(10):1729-1736
A类：
WikiPathways,BioCarta,RegNetwork,DSigDB
B类：
哮喘,SARS,CoV,相互作用关系,生物信息学分析,生物信息学方法,潜在机制,新线,研究数据,数据来源,GEO,Perl,差异表达基因,DEGs,功能富集分析,Reactome,通路富集分析,Cytoscape,蛋白质相互作用,PPI,TF,NetworkAnalyst,miRNA,调控网络,治疗药物,选得,病毒蛋白,细胞因子受体,补体,凝血级联反应,关键基因,药物分子,雷洛昔芬,他莫昔芬,孕酮,肺部疾病,蛋白互作
AB值：
0.305362
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
