典型文献
基于高通量测序的当归抽薹相关基因分析
文献摘要：
目的:筛选与当归抽薹相关的基因并探讨其分子机制.方法:取抽薹和未抽薹当归植株,剪取倒数第三片功能叶中部小叶片,利用BGISEQ-500测序平台对当归叶片基因进行高通量测序,再通过非冗余蛋白(NR)、核酸序列(NT)、Swiss-Prot、InterPro、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、真核生物蛋白相邻类的聚簇(KOG)、基因本体(GO)数据库进行功能基因注释.结果:抽薹当归与未抽薹当归共有936个差异表达基因(DEGs),在公共数据库比对得到867个DEGs,其中505个基因有明确功能,这些功能基因中有182个上调基因.在DEGs中筛选与当归抽薹相关的基因.其中调节细胞生长的基因有CDC48C、CSLA2、CYCA1-1、AUG8、CER26、At1g65390、BTAF1;调节开花的基因有TPS1、ALA6、AP2、SOCI;调节叶片光合作用的基因主要有CAB37、CAP10A.结论:细胞形态建成相关的基因在抽薹当归叶的生长发育过程中发挥了重要作用.抽薹和未抽薹当归差异表达基因的研究丰富了当归基因资源,为进一步开展分子生物学及分子育种研究提供了基础数据.
文献关键词：
当归;抽薹;转录组;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
王振恒;王引权;雒军;荔淑楠;晋玲;陈燕
作者机构：
甘肃中医药大学 药学院,甘肃 兰州 730000;甘肃省高校中(藏)药化学与质量研究省级重点实验室,甘肃 兰州 730000;西北中藏药协同创新中心,甘肃 兰州 730000
文献出处：
引用格式：
[1]王振恒;王引权;雒军;荔淑楠;晋玲;陈燕-.基于高通量测序的当归抽薹相关基因分析)[J].中国现代中药,2022(02):243-248
A类：
CDC48C,CSLA2,CYCA1,AUG8,CER26,At1g65390,BTAF1,ALA6,SOCI,CAB37,CAP10A
B类：
当归,抽薹,基因分析,植株,剪取,倒数第,三片,功能叶,小叶,BGISEQ,测序平台,片基,非冗余,NR,NT,Swiss,Prot,InterPro,京都基因与基因组百科全书,真核生物,生物蛋白,白相,邻类,聚簇,KOG,基因本体,功能基因注释,差异表达基因,DEGs,公共数据库,库比,细胞生长,开花,TPS1,AP2,叶片光合,光合作用,细胞形态,形态建成,基因资源,分子生物学,分子育种,育种研究,转录组
AB值：
0.361291
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