典型文献
苍术根茎转录组比较分析及倍半萜生物合成基因发掘
文献摘要：
为了研究苍术根茎不同生长发育时期转录水平差异,发掘其中倍半萜类化合物生物合成途径相关酶编码基因,对3个不同生长发育时期苍术根茎进行了转录组测序及比较分析.利用Illumina NovaSeq 6000技术对生长期(SZ)、开花期(KH)和采收期(CS)的苍术根茎进行了 cDNA文库测序.共得到388 201 748条clean reads,比较SZ vs KH、KH vs CS、SZ vs CS,分别鉴定到16 925、8 616、13 702条差异表达基因(DEGs),注释到53条可能参与到倍半萜生物合成途径中的基因,其中甲羟戊酸(MVA)途径上注释到可能编码6种酶的9条基因,2-C-甲基-D-赤藓糖醇-4-磷酸(MEP)途径中注释到可能编码7种酶的15条基因,倍半萜和三萜生物合成代谢通路中注释到29条基因.通过基因共表达网络分析(WGCNA)得到与生长期、开花期和采收期相关的倍半萜类化合物生物合成关键基因分别有12、1、1条,再联合共表达网络图挖掘到多个倍半萜类化合物合成候选基因.该研究为探索研究苍术根茎中倍半萜类化合物的生物合成途径并解析其表达调控与倍半萜类物质累积的分子机制奠定了基础.
文献关键词：
苍术根茎;倍半萜生物合成;转录组分析
中图分类号：
作者姓名：
曹也;张文晋;常丽坤;康传志;王月枫;谢冬梅;王升;郭兰萍
作者机构：
安徽中医药大学药学院,安徽合肥230012;中国中医科学院中药资源中心道地药材国家重点实验室培育基地,北京100700;广东药科大学中药学院,广东广州510006
文献出处：
引用格式：
[1]曹也;张文晋;常丽坤;康传志;王月枫;谢冬梅;王升;郭兰萍-.苍术根茎转录组比较分析及倍半萜生物合成基因发掘)[J].中国中药杂志,2022(18):4895-4907
A类：
倍半萜生物合成
B类：
苍术根茎,生物合成基因,基因发掘,生长发育时期,转录水平,倍半萜类化合物,生物合成途径,编码基因,转录组测序,Illumina,NovaSeq,生长期,SZ,开花期,KH,采收期,CS,cDNA,文库,clean,reads,差异表达基因,DEGs,甲羟戊酸,MVA,赤藓糖醇,MEP,三萜,合成代谢,代谢通路,基因共表达网络分析,WGCNA,关键基因,再联合,合共,网络图,图挖掘,候选基因,探索研究,表达调控,萜类物质,转录组分析
AB值：
0.262293
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