目的 研究钩枝藤总生物碱对非小细胞肺癌细胞系表达谱的影响,筛选出差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并对功能基因进行分析和挖掘,以期为钩枝藤抗肺癌的分子机制提供理论依据.方法 将非小细胞肺癌NCI-H1975细胞分为对照组和钩枝藤总生物碱处理组,使用RNA-Seq技术开展全转录组测序,获取DEGs;对DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;筛选差异基因核心模块并分析其影响功能,进一步分析关键基因对非小细胞肺癌生存期的影响;通过分析钩枝藤总生物碱对非小细胞肺癌免疫细胞肿瘤浸润的情况,确定关键基因表达与免疫浸润水平的相关性.结果 对照组和药物组共检测到2976个DEGs,其中药物组664个DEGs上调,2312个DEGs下调.钩枝藤总生物碱对铁死亡、氧化磷酸化、线粒体、溶酶体、细胞间隙连接、核苷酸结合寡聚化结构域(nucleotide binding oligomerization domain,NOD)样受体等介导的信号通路产生重要影响.在DEGs核心模块中,白细胞介素11(interleukin 11,IL11)的高表达可显著影响非小细胞肺癌患者的生存期,是非小细胞肺癌患者不良预后的关键因素之一;角形四肽重复干扰素诱导蛋白3(interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3,IFIT3)、白细胞介素 7 受体(interleukin 7receptor,IL7R)、2',5'-寡腺苷酸合成酶 2(2';5'-oligoadenylate synthetase 2,OAS2)、S-腺苷甲硫氨酸基结构域蛋白 2(radical S-adenosyl methionine domain containing 2,RSAD2)、受体转运蛋白 4(receptor transporter protein 4,RTP4)、不育 a 基序结构域 9 样(sterile alpha motif domain containing 9-like gene,SAMD9L)、X染色体连锁凋亡抑制蛋白相关因子1(X-linked inhibitor of apoptosis associated factor 1,XAF1)的表达水平影响了非小细胞肺癌组织的纯度和免疫细胞浸润的类型,可能改变非小细胞肺癌的免疫微环境.结论 钩枝藤总生物碱能够影响非小细胞肺癌细胞的转录谱,具有潜在的抗非小细胞肺癌活性作用.

钩枝藤;非小细胞肺癌;生物碱;转录组测序;免疫浸润

李中玉;赵一燃;门磊;弓晓杰;李珂珂

大连民族大学生命科学学院,辽宁大连 116600;生物技术与资源利用教育部重点实验室,辽宁大连 116600;辽宁省民族药功效成分开发与应用重点实验室,辽宁大连 116600

中草药

[1]李中玉;赵一燃;门磊;弓晓杰;李珂珂-.钩枝藤总生物碱对非小细胞肺癌细胞系表达谱及免疫微环境的影响)[J].中草药,2022(17):5417-5426

钩枝藤,IL11,7receptor,oligoadenylate,RTP4,SAMD9L

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