典型文献
基于GEO数据库的肾上腺皮质腺癌关键基因筛选及预后分析
文献摘要:
目的 探究与肾上腺皮质腺癌发生发展相关的关键基因并进行预后分析,挖掘潜在诊断和治疗靶点.方法 利用生物信息学技术对GSE12368、GSE19750、GSE143383、GSE90713、GSE14922、GSE75415共6个数据集行差异基因表达分析,获取共同差异表达基因,STRING数据库针对差异基因行蛋白表达网络分析,并运用Cytoscape软件cytoHubba插件获取排名前5的5个关键基因.对5个关键基因行GO、KEGG富集分析,并利用GEPIA2工具行生存分析.结果 6个数据集差异基因分析取交集得到差异基因共16个,其中上调基因5个,下调基因11个,cytoHubba插件共筛选出5个关键基因(CCNB1、TOP2A、TPX2、ZWINT、NCAPG),均为上调基因.富集分析提示5个关键基因参与细胞周期检查点、染色体分离、DNA构象改变、有丝分裂细胞周期负调控、细胞器合成等多种过程,且生存分析提示5个关键基因在肾上腺皮质腺癌中高表达,与较差的预后相关.结论 CCNB1、TOP2A、TPX2、ZWINT、NCAPG与肾上腺皮质腺癌预后密切相关,是其潜在的诊断标志物及治疗靶点.
文献关键词:
肾上腺皮质腺癌;关键基因;生物信息学;预后
中图分类号:
作者姓名:
周乃春;樊瑞新;张少朋;顾朝辉;陆伟
作者机构:
信阳市中心医院泌尿外科,河南信阳 464000;郑州大学附属信阳医院泌尿外科,河南信阳 464000;郑州大学第一附属医院泌尿外科,河南郑州 450052
文献出处:
引用格式:
[1]周乃春;樊瑞新;张少朋;顾朝辉;陆伟-.基于GEO数据库的肾上腺皮质腺癌关键基因筛选及预后分析)[J].现代泌尿外科杂志,2022(02):161-165
A类:
GSE12368,GSE19750,GSE143383,GSE90713,GSE14922,GSE75415
B类:
GEO,肾上腺皮质腺癌,关键基因筛选,预后分析,诊断和治疗,治疗靶点,利用生物,生物信息学技术,差异基因表达分析,差异表达基因,STRING,Cytoscape,cytoHubba,插件,富集分析,GEPIA2,生存分析,差异基因分析,析取,交集,CCNB1,TOP2A,TPX2,ZWINT,NCAPG,细胞周期检查点,构象,有丝分裂,分裂细胞,负调控,细胞器,种过,诊断标志物
AB值:
0.272695
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