目的 通过生物信息学分析方法,探讨GPCR116基因与肺腺癌发生、发展的相关性及其作用机制.方法 从GEO数据库下载GSE68465数据集(包含442例肺腺癌组织样本和20例正常组织样本的mRNA数据及基本临床资料).分析正常组织与肺腺癌组织中GPCR116基因表达量的差异,以及GPCR116基因表达量对肺腺癌患者预后的影响及其与临床特征的相关性;使用基因集富集分析(GSEA)预测GPCR116基因在肺腺癌中参与的信号通路;筛选出差异表达基因(DEGs)进行基因本体论(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,对GPCR116基因与上调和下调最显著的40个DEGs进行相关性分析;构建PPI网络,分析PPI网络的中心节点蛋白,筛选出肺腺癌的关键基因.结果 (1)与正常组织相比,GPCR116基因在肺腺癌组织中的表达量明显升高;GPCR116表达量是肺腺癌患者预后的独立影响因素,GPCR116高表达组的预后较好,且GPCR116基因的表达量与T分期、N分期及吸烟史相关(均P＜0.05).(2)GPCR116基因高表达组主要富集在溶酶体,低表达组主要富集在细胞周期、P53信号通路、错配修复、卵母细胞减数分裂等信号通路中.(3)共筛选出DEGs 235个,包括下调基因103个,上调基因132个.GO富集分析结果显示:DEGs的生物过程主要涉及细胞核分裂、细胞器裂变、有丝分裂细胞周期相变等;KEGG通路富集分析结果显示:DEGs主要在人类T细胞白血病病毒1感染、细胞周期、类风湿性关节炎等信号通路中富集.(4)GPCR116的表达量与13个显著性差异基因的表达量呈正相关,与20个显著性差异基因的表达量呈负相关.PPI网络分析共得到 10 个关键基因(NKX2-1、SFTPB、SFTPC、SCGB1A1、PITX1、FOXM1、MYBL2、CDCA3、TFF1、WIF1).结论 GPCR116基因在肺腺癌组织中显著高表达,且其表达量与肺腺癌患者的预后相关,可作为肺腺癌患者预后的预测因素.P53信号通路、错配修复、溶酶体蛋白等通过调控GPCR116基因的表达而在肺腺癌的发生、发展中发挥重要作用,其作用机制可能与筛选出的10个关键基因有关.

GPCR116基因;肺腺癌;生物信息学;差异基因;预后;作用机制

黄勋功;冯旭;涂顺珂

广西医科大学第一附属医院心胸外科,广西南宁市 530021

微创医学

[1]黄勋功;冯旭;涂顺珂-.基于生物信息学方法分析GPCR116基因与肺腺癌的相关性及其作用机制)[J].微创医学,2022(06):729-736

GPCR116,SFTPB,SCGB1A1

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