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高浓度地塞米松对骨髓间充质干细胞小分子非编码RNA表达的调控机制研究
文献摘要：
目的 探讨高浓度地塞米松对骨髓间充质干细胞(BMSCs)小分子非编码RNA(sncRNA)表达的调控机制.方法 体外分离并培养小鼠BMSCs,阴性对照组(NC组)与地塞米松组(DEX组)分别使用含0.1 μmol/L、10 μmol/L地塞米松的诱导液进行诱导.通过茜素红染色分析BMSCs的成骨分化情况.运用Illumina Hiseq 2500平台进行高通量small RNA测序,筛选NC组与DEX组差异表达的sncRNAs,并进行生物信息学分析.结果 茜素红染色结果显示,与NC组相比,DEX组茜素红染色变浅,半定量检测结果显示DEX组钙结节含量显著降低.DEX 组与NC组的差异基因中,| log2Fold Changel≥1的微小RNA(miRNA)有25个,其中DEX组的6个miRNAs表达上调,19个miRNAs表达下调(均P＜0.05).基因本体论(GO)分析结果显示,上调的差异miRNAs的靶基因主要参与蛋白质磷酸化、肌肉和器官发育、细胞黏附等生物过程,下调的差异miRNAs的靶基因主要参与蛋白质自磷酸化、蛋白质泛素化、细胞内雌激素受体信号通路、细胞增殖等生物过程.京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示,上调的差异miRNAs主要富集在脂肪合成相关信号通路、Ras信号通路、钙信号通路等,下调的差异miRNAs主要富集在Wnt信号通路、Hippo信号通路等.DEX组与NC组的差异基因中,| log2Fold Change|≥1 的PIWI相互作用RNA(piRNA)有3个,其中DEX组的1个piRNA表达上调,2个piRNAs表达下调;llog2Fold Changel≥1的重复相关小于扰RNA(rasiRNA)有2个,两者在DEX组中的表达均上调;llog2Fold Change |≥1的核仁小(snoRNA)有8个,其中DEX组有6个snoRNAs表达上调,2个snoRNAs表达下调;| log2Fold Changel≥1的核小RNA(snRNA)仅有1个,该基因在DEX组中表达下调(均P＜0.05).结论 高通量small RNA测序技术能够有效检测到经高浓度地塞米松处理后小鼠BMSCs中差异表达的sncRNAs,且信号通路分析提示差异表达的miRNAs可能参与脂肪代谢和成骨代谢等多个生物学过程.
文献关键词：
地塞米松;骨髓间充质干细胞;小分子非编码RNA;成骨分化
中图分类号：
作者姓名：
周兴;刘凯;彭建平;王传东;张晓玲
作者机构：
广西医科大学再生医学与医用生物资源开发应用省部共建协同创新中心,广西再生医学重点实验室,广西南宁市 530021;上海交通大学医学院附属新华医院骨科实验室,上海市 200092
文献出处：
引用格式：
[1]周兴;刘凯;彭建平;王传东;张晓玲-.高浓度地塞米松对骨髓间充质干细胞小分子非编码RNA表达的调控机制研究)[J].微创医学,2022(02):141-148
A类：
log2Fold,Changel,llog2Fold,rasiRNA
B类：
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AB值：
0.239777
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