典型文献
肾透明细胞癌中具有预后预测价值免疫相关基因的筛选
文献摘要：
目的 挖掘肾透明细胞癌(ccRCC)中具有预后预测价值的免疫相关基因.方法 从遗传病控制(GDC)网站下载534例ccRCC基因表达数据和相应的临床信息,以ESTIMATE算法对所下载的数据进行免疫评分和基质评分.按照评分高低分为高分组和低分组,研究其对总生存和无病生存期的影响,确定差异表达与预后显著相关基因.应用DAVID数据库对差异表达基因进行功能富集分析,采用Kaplan-Meier法进行生存分析,在STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,并在GEO数据集中进一步验证.结果 挖掘出12个可预测ccRCC无病生存期的免疫微环境相关基因(BCL3、F3、HLF、HNRNPAB、SHOX2、SNRPB2、USP5、ALX1、FAM50A、USP39、DBF4、SPIN1)(P<0.05),1个蛋白互作网络枢纽基因(RAC3).其中DBF4、USP5和HLF基因均出现于TCGA、GEO数据库和差异表达的预后PPI网络中.结论 本研究所筛选的核心免疫微环境相关基因可能与ccRCC预后相关,其中HLF、USP5、DBF4和RAC3有望成为ccRCC治疗的新靶点,其具体机制尚需进一步实验阐明.
文献关键词：
肾透明细胞癌;免疫微环境;预后
中图分类号：
作者姓名：
徐明;薛波新;阳东荣;朱进
作者机构：
215004 苏州大学附属第二医院泌尿外科
文献出处：
引用格式：
[1]徐明;薛波新;阳东荣;朱进-.肾透明细胞癌中具有预后预测价值免疫相关基因的筛选)[J].现代泌尿生殖肿瘤杂志,2022(01):8-15
A类：
SNRPB2,USP5,ALX1,FAM50A,DBF4,SPIN1,RAC3
B类：
肾透明细胞癌,预后预测,预测价值,免疫相关基因,ccRCC,遗传病,GDC,站下,下载,基因表达数据,临床信息,ESTIMATE,免疫评分,总生存,无病生存期,DAVID,差异表达基因,功能富集分析,Kaplan,Meier,生存分析,STRING,蛋白质相互作用,PPI,GEO,挖掘出,免疫微环境,BCL3,F3,HLF,HNRNPAB,SHOX2,USP39,蛋白互作网络,枢纽基因,TCGA,新靶点,具体机制,尚需
AB值：
0.300194
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
