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白羽扇豆WRKY转录因子家族鉴定及生物信息学分析
文献摘要：
WRKY转录因子家族在植物生命活动中具有重要作用.利用生物信息学方法分析白羽扇豆基因组数据,对LaWRKY转录因子家族成员进行鉴定及染色体定位,同时分析其蛋白理化性质、系统发育进化关系、保守基序分布、保守结构域位置、基因结构及启动子-顺式作用元件等,并从系统发育进化的同源性、启动子-顺式作用元件等多角度对LaWRKY转录因子功能进行预测.结果表明,在白羽扇豆中共鉴定到106个LaWRKY转录因子家族成员,各成员不均匀地分布在24条染色体上,但18号染色体上无分布;106个成员聚类为3个亚族(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),各亚族成员的保守基序分布相似,对应的保守结构域、基因结构特征也表现一定的规律性,多角度预测到LaWRKY转录因子与植物激素、环境变化等方面有关联.本研究为深入解析LaWRKY转录因子对白羽扇豆生命活动的调控作用提供理论参考.
文献关键词：
白羽扇豆;基因组;WRKY转录因子;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
亚华金;沈莲文;周涛;李明谦;余文才;和丽岗
作者机构：
云南省热带作物科学研究所 云南西双版纳 666100;西南林业大学林学院 云南昆明 650224
文献出处：
引用格式：
[1]亚华金;沈莲文;周涛;李明谦;余文才;和丽岗-.白羽扇豆WRKY转录因子家族鉴定及生物信息学分析)[J].热带农业科学,2022(12):42-53
A类：
LaWRKY
B类：
白羽扇豆,生物信息学分析,生命活动,利用生物,生物信息学方法,基因组数据,染色体定位,系统发育,进化关系,保守基序,保守结构域,基因结构,启动子,顺式作用元件,同源性,无分,角度预测,植物激素
AB值：
0.165976
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