本研究共鉴定出16个单、双子叶植物和卷柏的211个DUF1685基因家族成员.蛋白理化性质分析表明,211个DUF1685s基因的氨基酸序列长度为83～1071 aa,分子量为9.2～116.3 kDa,理论等电点为3.66～11.90.系统发育进化分析表明,DUF1685基因家族被划分了3个亚家族(Class I、ClassⅡ和ClassⅢ),Class I和ClassⅡ亚家族产生A1和A2、B1和B2的事件发生在单、双子叶植物分化后,同时A1和B2分支(成员均为双子叶植物基因)出现了基因扩张现象.保守基序和基因结构分析结果表明,同一亚家族成员之间保守基序相似,211个DUF1685基因家族成员中大部分含有1个内含子,少部分基因含有2个及以上内含子或者不含内含子.选择压分析表明,DUF1685基因家族在进化过程中相关位点受到正向选择,这可能是导致部分基因发生功能变化的原因.共线性分析表明,片段复制事件可能是玉米DUF1685基因扩增和进化的潜在驱动力.基因启动子区域顺式元件分析结果表明,玉米DUF1685基因启动子区域含有光响应元件、ABA和非生物胁迫相关的顺式作用元件,推测这些基因可能参与玉米对非生物胁迫的响应.转录组数据分析表明,玉米DUF1685基因与特定组织(成熟花粉)的生长发育相关.本研究从多方面探究了玉米DUF1685基因家族的功能和进化情况,以期为今后深入研究玉米DUF1685基因生物学功能和进化关系提供理论参考.

DUF1685基因;基因鉴定;进化分析

罗璇;林正雨;陈章;雷波;李洁;全津莹;刘海岚

四川省农业科学院农业信息与农村经济研究所,四川成都 610066;四川农业大学玉米研究所,四川成都 611130

热带作物学报

[1]罗璇;林正雨;陈章;雷波;李洁;全津莹;刘海岚-.玉米DUF1685基因家族的鉴定和进化分析)[J].热带作物学报,2022(12):2431-2442

DUF1685,DUF1685s

基因家族,进化分析,双子叶,卷柏,性质分析,氨基酸序列,aa,分子量,kDa,等电点,系统发育,亚家族,Class,A1,A2,B1,B2,植物基,保守基序,基因结构,内含子,少部分,压分,正向选择,共线性分析,基因扩增,基因启动子区,启动子区域,光响应,响应元,ABA,非生物胁迫,顺式作用元件,转录组数据,花粉,生物学功能,进化关系,基因鉴定

0.239945