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尖刀唇石斛和翅梗石斛叶绿体全基因组分析
文献摘要：
目的 测定尖刀唇石斛Dendrobium heterocarpum和翅梗石斛D.trigonopus叶绿体基因组,分析其序列特征并鉴定石斛属Dendrobium植物物种间亲缘关系.方法 利用Illumina Hisep 2 500测序平台对尖刀唇石斛和翅梗石斛进行二代测序,经组装、注释后得到2条完整的叶绿体全基因组序列,采用生物信息学方法分析其序列结构及石斛属的系统发育关系.结果 尖刀唇石斛的叶绿体全基因组总长为159 786 bp,总GC含量为37.2％,共注释得到131个基因,包括88个蛋白编码基因、37个tRNA基因和6个rRNA基因;翅梗石斛的叶绿体全基因组总长为159 652 bp,总GC含量为37.1％,共注释得到131个基因,包括88个蛋白编码基因、37个tRNA基因和6个rRNA基因.尖刀唇石斛和翅梗石斛分别检测到112和127个简单重复序列(SSR),二者编码亮氨酸的密码子数量最多,编码色氨酸的密码子数量最少.系统发育树显示,尖刀唇石斛、反瓣石斛D.ellipsophyllum、翅梗石斛、梳唇石斛D.strongylanthum和长距石斛D.longicornu聚为一支,翅梗石斛与梳唇石斛和长距石斛的亲缘关系十分相近,支持率达到100％.结论 对石斛属2种植物的叶绿体基因组结构和系统发育关系进行了分析,该研究结果将为石斛属药用植物的准确鉴定、开发利用及其资源保护提供科学依据.
文献关键词：
尖刀唇石斛;翅梗石斛;药用植物;叶绿体全基因组;亲缘关系
中图分类号：
作者姓名：
李卓蔚;邱迁;郎佳琪;吴应梅;杜慧慧;周浓
作者机构：
重庆三峡学院生物与食品工程学院,重庆 404120;三峡库区道地药材绿色种植与深加工重庆市工程实验室,重庆 404120
文献出处：
引用格式：
[1]李卓蔚;邱迁;郎佳琪;吴应梅;杜慧慧;周浓-.尖刀唇石斛和翅梗石斛叶绿体全基因组分析)[J].中草药,2022(16):5159-5169
A类：
尖刀唇石斛,翅梗石斛,heterocarpum,trigonopus,Hisep,ellipsophyllum,strongylanthum,longicornu
B类：
石斛叶,叶绿体全基因组,全基因组分析,Dendrobium,叶绿体基因组,序列特征,石斛属,植物物种,种间,亲缘关系,Illumina,测序平台,二代测序,全基因组序列,生物信息学方法,序列结构,系统发育关系,总长,bp,蛋白编码,编码基因,tRNA,rRNA,简单重复序列,SSR,亮氨酸,密码子,色氨酸,系统发育树,梳唇石斛,支持率,基因组结构,药用植物,资源保护
AB值：
0.179576
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