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基于nrDNA和cpDNA序列的甘肃省4种肉苁蓉种质资源分子鉴定
文献摘要:
目的 筛选能够准确鉴定甘肃省不同肉苁蓉种质的序列,探究甘肃省肉苁蓉种质资源遗传关系.方法 利用筛选出的4对引物(ITS2F-ITS3R、CD1F-CD1R、matK3F-matK1R和rbcL1F-rbcL724R)对甘肃省肉苁蓉、沙苁蓉、盐生肉苁蓉和兰州肉苁蓉4种共27份肉苁蓉样品基因组序列进行扩增测序,分析样品的序列特征、核苷酸多态性、单倍型多样性,构建邻接法(NJ)聚类树,从nrDNA和cpDNA两方面进行遗传变异研究.结果 cpDNA合并序列GC含量比nrDNA合并序列低,为34.6%;matK序列的变异位点明显高于ITS、CD及rbcL序列,共检测到481个多态性变异位点;两组合并序列单倍型多样性值均大于0.5,多样性程度较高;NJ聚类树显示,nrDNA和cpDNA的合并序列联合使用更适用于肉苁蓉不同种质的鉴别;肉苁蓉遗传变异主要来自组内变异,即同一物种不同种质间分化明显,nrDNA和cpDNA组内变异百分比分别为79.32%和76.93%.结论 甘肃省肉苁蓉种质资源遗传多样性较为丰富,nrDNA和cpDNA的合并序列能准确鉴定甘肃省4种肉苁蓉.
文献关键词:
甘肃省;肉苁蓉;nrDNA;cpDNA;分子鉴定
中图分类号:
作者姓名:
康舒淇;徐丽;张明惠;陈博;晋玲;朱田田
作者机构:
甘肃中医药大学,甘肃 兰州 730000;西北中藏药省部共建协同创新中心,甘肃 兰州 730000;甘肃省珍稀中药资源评价与保护利用工程研究中心,甘肃 兰州 730000
文献出处:
引用格式:
[1]康舒淇;徐丽;张明惠;陈博;晋玲;朱田田-.基于nrDNA和cpDNA序列的甘肃省4种肉苁蓉种质资源分子鉴定)[J].中国中医药信息杂志,2022(12):104-111
A类:
ITS2F,ITS3R,CD1F,CD1R,matK3F,matK1R,rbcL1F,rbcL724R,盐生肉苁蓉
B类:
nrDNA,cpDNA,种质资源,分子鉴定,遗传关系,引物,兰州,基因组序列,序列特征,多态性,单倍型多样性,邻接,接法,NJ,遗传变异,变异位点,点明,联合使用,组内变异,一物,遗传多样性
AB值:
0.143231
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