典型文献
五月艾Artemisia indica叶绿体基因组结构及系统发育分析
文献摘要：
五月艾Artemisia indica是菊科蒿属重要的药用植物,但目前对于五月艾分子遗传信息了解很少.该研究通过高通量测序技术对五月艾叶绿体基因组进行测序、组装和注释,并对其序列特征、重复序列、密码子偏好性和系统发育进行分析.结果表明,五月艾叶绿体基因组全长151 161 bp,为典型的环状四段式结构,包括2个反向重复区(IRs),1个大单拷贝区(LSC)和1个小单拷贝区(SSC),GC量为37.47％;共注释到132个基因,去重复之后为114个,包括80个蛋白编码基因,30个tRNA基因和4个rRNA基因.从叶绿体基因组中共检测到50个长重复序列和191个SSR,其中SSR类型主要以单核苷酸为主.密码子偏好性分析显示,亮氨酸是五月艾叶绿体基因组中使用次数最高的氨基酸(10.77％),同义密码子相对使用频次(RSCU,relative synonymous codon usage)＞1的密码子有30种且均以A/U结尾.基于菊科19个物种叶绿体基因组构建的系统发育树显示,五月艾与艾叶的亲缘关系最近,蒿属物种聚为单独的进化分支.该研究结果将为蒿属药用植物遗传多样性和资源保护提供理论依据.
文献关键词：
五月艾;叶绿体基因组;SSR;密码子偏好性;系统发育分析
中图分类号：
作者姓名：
兰朝辉;田徐芳;师玉华;高冉冉;尹青岗;向丽;邬兰
作者机构：
中国中医科学院中药研究所青蒿素中心,北京100700;湖北中医药大学药学院,湖北武汉430056
文献出处：
引用格式：
[1]兰朝辉;田徐芳;师玉华;高冉冉;尹青岗;向丽;邬兰-.五月艾Artemisia indica叶绿体基因组结构及系统发育分析)[J].中国中药杂志,2022(22):6058-6065
A类：
B类：
五月艾,Artemisia,indica,叶绿体基因组,基因组结构,系统发育分析,菊科,蒿属,药用植物,分子遗传,遗传信息,高通量测序技术,艾叶,序列特征,重复序列,密码子偏好性,基因组全长,bp,四段,段式,式结构,重复区,IRs,拷贝,LSC,SSC,蛋白编码,编码基因,tRNA,rRNA,SSR,单核苷酸,偏好性分析,亮氨酸,使用次数,同义密码子,使用频次,RSCU,relative,synonymous,codon,usage,结尾,组构,系统发育树,亲缘关系,进化分支,遗传多样性,资源保护
AB值：
0.301007
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