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枣瘿蚊图尔病毒(DjTV-2a)衣壳蛋白生物信息学分析及抗原表位预测
文献摘要：
分析枣瘿蚊图尔病毒(DjTV-2a)衣壳蛋白的理化性质、蛋白结构及抗原表位.从UniProt数据库中得到DjTV-2a衣壳蛋白的氨基酸序列,利用Expasy、TMHMM、DNAStar、SignalP 5.0、TMHMM、NetPhos 3.1、NET CGlyc 1.0、SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息学软件,预测DjTV-2a衣壳蛋白的理化性质、氨基酸组成、亲疏水性、信号肽、跨膜结构、磷酸化位点、糖基化位点、二级结构、三级结构和抗原表位等.结果表明,DjTV-2 a衣壳蛋白是由449个氨基酸构成的亲水蛋白,分子式为C2337H3607N601O689S15,分子量为51.6 ku,理论等电点为5.98;主要二级结构是无规则卷曲,存在82个磷酸化位点和1个糖基化位点,无信号肽和跨膜结构;该蛋白有21个B细胞优势抗原表位和10个T细胞优势抗原表位.DjTV-2 a衣壳蛋白属亲水蛋白,具有多个抗原表位,预测其具有免疫原性,是可用作建立血清学检测技术的潜在抗原.
文献关键词：
枣瘿蚊;图尔病毒;衣壳蛋白;生物信息学;抗原表位
中图分类号：
作者姓名：
张来斌;马光皇;刘语涵;贺鹏鹏;肖海兵;杨明禄
作者机构：
塔里木大学农学院,新疆阿拉尔843300;南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室,新疆阿拉尔843300
文献出处：
引用格式：
[1]张来斌;马光皇;刘语涵;贺鹏鹏;肖海兵;杨明禄-.枣瘿蚊图尔病毒(DjTV-2a)衣壳蛋白生物信息学分析及抗原表位预测)[J].江苏农业科学,2022(09):33-36
A类：
图尔病毒,DjTV,CGlyc,C2337H3607N601O689S15
B类：
枣瘿蚊,2a,衣壳蛋白,生物信息学分析,抗原表位,表位预测,蛋白结构,UniProt,氨基酸序列,Expasy,TMHMM,DNAStar,SignalP,NetPhos,NET,SOPMA,SWISS,MODEL,生物信息学软件,氨基酸组成,亲疏水性,信号肽,膜结构,磷酸化,糖基化位点,二级结构,三级结构,亲水,分子式,分子量,ku,等电点,无规则,卷曲,免疫原性,血清学检测技术
AB值：
0.264266
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